45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1227 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  68.35 
 
 
227 aa  235  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  44.91 
 
 
199 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  45 
 
 
178 aa  147  1e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  47.26 
 
 
186 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  47.26 
 
 
192 aa  145  4e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  43.59 
 
 
191 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  45.21 
 
 
209 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  45.89 
 
 
182 aa  140  2e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  43.84 
 
 
182 aa  139  4e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  39.88 
 
 
203 aa  136  3e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  39.88 
 
 
206 aa  131  8e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  38.56 
 
 
241 aa  129  4e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  38 
 
 
190 aa  115  7e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  33.58 
 
 
175 aa  109  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  34.75 
 
 
167 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  34.29 
 
 
167 aa  108  8e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  39.29 
 
 
162 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  36.17 
 
 
167 aa  105  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  35.46 
 
 
204 aa  105  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  31.69 
 
 
164 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  31.21 
 
 
169 aa  96.3  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  32.05 
 
 
227 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  32.05 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  30.97 
 
 
225 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  31.43 
 
 
169 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  31.43 
 
 
169 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  34.69 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  29.37 
 
 
169 aa  89.7  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  33.57 
 
 
173 aa  87.8  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  29.19 
 
 
177 aa  85.9  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  28.57 
 
 
176 aa  82.8  4e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  28.57 
 
 
176 aa  82.8  4e-15  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  28.08 
 
 
176 aa  82.8  4e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  29.29 
 
 
167 aa  81.3  1e-14  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  28.38 
 
 
175 aa  80.5  2e-14  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  30 
 
 
165 aa  79.3  5e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  27.89 
 
 
182 aa  79.3  5e-14  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  25.9 
 
 
178 aa  72.4  5e-12  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  24.03 
 
 
168 aa  63.5  2e-09  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2793  hypothetical protein  26 
 
 
162 aa  62.8  4e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0707  hypothetical protein  27.34 
 
 
166 aa  56.2  4e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_002978  WD1065  hypothetical protein  26.09 
 
 
165 aa  53.5  3e-06  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0282386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1438  hypothetical protein  27.14 
 
 
165 aa  51.2  1e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2699  hypothetical protein  27.04 
 
 
312 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>