70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0195 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  70.7 
 
 		 187 aa  228  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  69.81 
 
 		 178 aa  219  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  68.79 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  64.71 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  66.04 
 
 		 176 aa  207  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  65.41 
 
 		 176 aa  205  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  64.78 
 
 		 176 aa  204  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  55.09 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  59.33 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  55 
 
 		 183 aa  171  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  53.7 
 
 		 173 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  49.44 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  54.14 
 
 		 177 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  47.77 
 
 		 177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  49.17 
 
 		 178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  47.13 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  43.09 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  46.5 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  45.4 
 
 		 184 aa  138  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  43.35 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  42.2 
 
 		 177 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  45.96 
 
 		 174 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  43.21 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  45.86 
 
 		 176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  39.88 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  42.33 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  33.33 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  35.92 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  41.1 
 
 		 168 aa  88.6  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  40.83 
 
 		 195 aa  88.2  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  34.94 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  37.41 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  32.2 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  35.81 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  35.14 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  35.81 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  35.14 
 
 		 138 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  35.14 
 
 		 138 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  35.14 
 
 		 138 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  35.14 
 
 		 138 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  35.14 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  34.09 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  36.3 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  38.26 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  33.78 
 
 		 138 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  31.79 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  35.33 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  36.76 
 
 		 157 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  30.99 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  30 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  29.05 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  25.83 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  34.23 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  28.29 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  32.89 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  32.89 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  31.01 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  25.9 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  26 
 
 		 140 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  26.9 
 
 		 149 aa  48.5  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  27.78 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4793  hypothetical protein  29.33 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  28.29 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  26.85 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  31.48 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2761  hypothetical protein  30.63 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.264134  normal  0.221278 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1581  hypothetical protein  29.2 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>