140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2359 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2359  SpoIID/LytB domain-containing protein  100 
 
 
421 aa  832    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000614702  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2831  SpoIID/LytB domain protein  63.87 
 
 
380 aa  442  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.835206  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1767  SpoIID/LytB domain-containing protein  40.11 
 
 
450 aa  202  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0035  SpoIID/LytB domain-containing protein  35.57 
 
 
508 aa  176  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000486765  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  37.62 
 
 
625 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4218  sporulation protein SpoIID-like  37.53 
 
 
384 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000195999  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5043  SpoIID/LytB domain protein  38.06 
 
 
386 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1608  SpoIID/LytB domain protein  38.87 
 
 
363 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1446  sporulation protein SpoIID-like  35.34 
 
 
391 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4515  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.92 
 
 
381 aa  163  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1802  SpoIID/LytB domain-containing protein  35.18 
 
 
378 aa  163  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.806202  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15491  sporulation protein SpoIID  34.4 
 
 
391 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15341  sporulation protein SpoIID  34.34 
 
 
391 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00436171  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0278  SpoIID/LytB domain protein  36.3 
 
 
382 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0642  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.01 
 
 
388 aa  155  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0335731  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2012  stage II sporulation protein D-like  36.71 
 
 
407 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.703242 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1785  sporulation protein and related proteins-like  36.16 
 
 
526 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.450539  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1392  SpoIID/LytB domain protein  32.07 
 
 
382 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1362  SpoIID/LytB domain protein  32.07 
 
 
382 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2625  SpoIID/LytB domain protein  29.65 
 
 
368 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1714  SpoIID/LytB domain-containing protein  35.02 
 
 
369 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0850  stage II sporulation-related protein  32.75 
 
 
376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2687  SpoIID/LytB domain protein  31.47 
 
 
383 aa  146  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2013  SpoIID/LytB domain protein  31.67 
 
 
376 aa  145  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.588704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2621  stage II sporulation-related protein  32.37 
 
 
321 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15091  sporulation protein SpoIID  31.01 
 
 
397 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1118  SpoIID/LytB domain protein  33.57 
 
 
463 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.819333  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14021  sporulation protein SpoIID  28.68 
 
 
432 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.388371  normal  0.301012 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0630  SpoIID/LytB domain protein  30.32 
 
 
381 aa  143  7e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0920  SpoIID/LytB domain protein  36.36 
 
 
437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0663861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1780  SpoIID/LytB domain protein  32.37 
 
 
369 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174571 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0919  sporulation protein SpoIID  32.47 
 
 
405 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17751  sporulation protein SpoIID  32.47 
 
 
405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0527  SpoIID/LytB domain protein  27.18 
 
 
546 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000920143  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10950  SpoIID/LytB domain protein  30.2 
 
 
708 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0118961  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1794  SpoIID/LytB domain protein  28.18 
 
 
720 aa  131  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160859 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0960  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.19 
 
 
570 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000216534  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0380  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.35 
 
 
686 aa  125  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000403516  hitchhiker  0.0000000000012381 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2374  sporulation protein and related proteins  33.69 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000760464 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2144  stage II sporulation protein D-like  40.97 
 
 
495 aa  121  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2437  SpoIID/LytB domain protein  30.43 
 
 
369 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.712007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17760  sporulation stage II protein D  32.23 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.377102  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0059  amidase enhancer  35.65 
 
 
519 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05351  sporulation protein SpoIID  38.11 
 
 
472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2838  SpoIID/LytB domain protein  36.53 
 
 
616 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156879  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2135  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.39 
 
 
322 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2743  SpoIID/LytB domain protein  36.23 
 
 
612 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0085  stage II sporulation protein D  33.82 
 
 
314 aa  117  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.622828  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17861  putative amidase enhancer  34.39 
 
 
457 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2281  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.26 
 
 
563 aa  117  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00377918  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0056  amidase enhancer  36.46 
 
 
515 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.982033  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3147  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.91 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4162  stage II sporulation protein D  33.45 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000996783  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2653  sporulation protein, amidase enhancer  35.93 
 
 
612 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2376  stage II sporulation protein D  31.27 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3325  SpoIID/LytB domain protein  38.39 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0346902  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1304  SpoIID/LytB domain protein  34.63 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4925  SpoIID/LytB domain protein  34.5 
 
 
558 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1696  sporulation protein and related proteins-like  32.28 
 
 
471 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00621  putative amidase enhancer  36.99 
 
 
527 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0506  SpoIID/LytB domain-containing protein  26.67 
 
 
366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.133427  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0757  amidase enhancer  33.44 
 
 
555 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1258  putative amidase enhancer  37.19 
 
 
517 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2545  stage II sporulation-related protein  35 
 
 
291 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3247  SpoIID/LytB domain protein  40.37 
 
 
443 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21291  putative amidase enhancer  37.41 
 
 
517 aa  113  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0680822  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1405  SpoIID/LytB domain protein  35 
 
 
291 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0533  stage II sporulation protein D-like  34.46 
 
 
489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2616  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.63 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2839  stage II sporulation protein D  29.64 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0106  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.54 
 
 
347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0712  SpoIID/LytB domain protein  34.29 
 
 
586 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  35.71 
 
 
762 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0087  sporulation protein and related proteins  33.08 
 
 
309 aa  110  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00338057  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0918  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.75 
 
 
536 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.478605  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4348  SpoIID/LytB domain protein  30.11 
 
 
530 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0244  SpoIID/LytB domain protein  35.15 
 
 
584 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4968  stage II sporulation protein D  30.71 
 
 
339 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0719716  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2187  SpoIID/LytB domain protein  34.08 
 
 
454 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3287  stage II sporulation protein D  31.02 
 
 
342 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2158  stage II sporulation protein D  27.99 
 
 
340 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21150  SpoIID/LytB domain protein  30.71 
 
 
316 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000468923  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5084  sporulation stage II protein D  29.74 
 
 
339 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0180  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.21 
 
 
533 aa  103  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5462  stage II sporulation protein D  31.34 
 
 
339 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000156076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5543  stage II sporulation protein D  30.11 
 
 
339 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00744425  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5407  stage II sporulation protein D  30.11 
 
 
339 aa  103  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0218  stage II sporulation protein D  30.26 
 
 
358 aa  102  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4986  stage II sporulation protein D  31.34 
 
 
339 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.579357  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5377  stage II sporulation protein D  30.34 
 
 
339 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000599037 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1318  SpoIID/LytB domain-containing protein  36.58 
 
 
259 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0300533  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0281  stage II sporulation protein D  28.09 
 
 
341 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.213834  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0600  SpoIID/LytB domain protein  29.62 
 
 
472 aa  100  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.455802  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4505  SpoIID/LytB domain protein  30.28 
 
 
537 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4443  SpoIID/LytB domain protein  30.28 
 
 
537 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5411  stage II sporulation protein D  30.97 
 
 
339 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0080939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5136  stage II sporulation protein D  30.97 
 
 
339 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5528  stage II sporulation protein D  30.97 
 
 
339 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3805  sporulation stage II protein D  30.74 
 
 
337 aa  99.8  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3399  stage II sporulation protein D  31.05 
 
 
343 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>