More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1769 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
313 aa  635  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  64.63 
 
 
311 aa  420  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  49 
 
 
322 aa  283  2e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  38.12 
 
 
350 aa  212  8e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  38.92 
 
 
323 aa  211  9e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  36.8 
 
 
358 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  38.8 
 
 
320 aa  209  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  38.42 
 
 
350 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  36.56 
 
 
323 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  37.46 
 
 
349 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  36.56 
 
 
323 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  37.5 
 
 
361 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  38.05 
 
 
335 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  36.48 
 
 
323 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  36.25 
 
 
323 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  37.89 
 
 
323 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  35.23 
 
 
353 aa  202  6e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  38.54 
 
 
404 aa  200  2e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  35.57 
 
 
363 aa  201  2e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  34.75 
 
 
355 aa  200  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  36.81 
 
 
347 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.61 
 
 
345 aa  198  1e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  35.29 
 
 
355 aa  197  2e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  36.42 
 
 
353 aa  196  5e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  37.85 
 
 
332 aa  196  5e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  37.27 
 
 
320 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.58 
 
 
316 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.26 
 
 
316 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  35.26 
 
 
319 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.58 
 
 
319 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.58 
 
 
316 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.14 
 
 
316 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  34.94 
 
 
316 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  36.23 
 
 
337 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  34.28 
 
 
360 aa  190  3e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.46 
 
 
316 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.46 
 
 
316 aa  189  6e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  37.15 
 
 
394 aa  189  6e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  34.62 
 
 
316 aa  189  6e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  33.61 
 
 
364 aa  188  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  38.2 
 
 
329 aa  188  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  37.81 
 
 
326 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  33.87 
 
 
319 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  37.27 
 
 
320 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  33.15 
 
 
369 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  37.38 
 
 
328 aa  184  2e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  37.38 
 
 
328 aa  184  2e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  38.33 
 
 
460 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  46.27 
 
 
460 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  33.06 
 
 
367 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  33.83 
 
 
347 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  33.99 
 
 
354 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  44.33 
 
 
460 aa  180  3e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  38.44 
 
 
327 aa  179  5e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  32.78 
 
 
365 aa  178  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  34.56 
 
 
380 aa  176  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  34.34 
 
 
343 aa  176  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  36.56 
 
 
322 aa  175  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  35.92 
 
 
328 aa  174  2e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  43.28 
 
 
449 aa  172  6e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  43.07 
 
 
457 aa  172  6e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  33.24 
 
 
366 aa  172  7e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  42.86 
 
 
452 aa  172  8e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  42.36 
 
 
449 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  33.14 
 
 
373 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  35.88 
 
 
356 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  35.67 
 
 
324 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  35.15 
 
 
339 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  41.87 
 
 
449 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  32.57 
 
 
327 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  37.11 
 
 
329 aa  167  3e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  30.87 
 
 
379 aa  167  3e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  32.05 
 
 
349 aa  166  4e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  30.52 
 
 
372 aa  166  4e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  32.52 
 
 
362 aa  166  6e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  33.24 
 
 
384 aa  165  7e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  42.33 
 
 
393 aa  165  7e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.68 
 
 
374 aa  164  1e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  45.16 
 
 
382 aa  163  4e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  35.46 
 
 
336 aa  163  4e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  33.54 
 
 
324 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  44.86 
 
 
378 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  44.86 
 
 
378 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  45 
 
 
493 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  44.15 
 
 
379 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41587  predicted protein  31.76 
 
 
339 aa  159  6e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0182638  normal  0.0311879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  33.94 
 
 
325 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  32.92 
 
 
344 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  32.23 
 
 
360 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  31.29 
 
 
346 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  32.6 
 
 
342 aa  156  5e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  31.96 
 
 
375 aa  156  5e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  31 
 
 
346 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  32.63 
 
 
352 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  30.77 
 
 
338 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  31.61 
 
 
360 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  39.6 
 
 
362 aa  153  3e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  30.65 
 
 
346 aa  153  3e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  33.13 
 
 
325 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0960  putative GTP-binding protein YjiA  33.13 
 
 
320 aa  152  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>