More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5163 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  38.49 
 
 
3335 aa  721    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  42.43 
 
 
2684 aa  729    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  39.36 
 
 
2710 aa  741    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5163  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
1174 aa  2290    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0962638  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  40.97 
 
 
2679 aa  764    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4625  amino acid adenylation domain-containing protein  80.98 
 
 
1153 aa  1752    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0810098 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5090  amino acid adenylation domain protein  80.89 
 
 
1153 aa  1731    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731614  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  34.06 
 
 
3235 aa  622  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  38.32 
 
 
2682 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  39.87 
 
 
6403 aa  607  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  36.14 
 
 
2581 aa  608  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  39.27 
 
 
4991 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  38.84 
 
 
4747 aa  595  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  35.09 
 
 
1093 aa  590  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0864  amino acid adenylation domain protein  34.27 
 
 
2063 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  38.33 
 
 
1129 aa  582  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  38.56 
 
 
3470 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  36.28 
 
 
6676 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  33.89 
 
 
1786 aa  571  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3185  amino acid adenylation domain protein  36.95 
 
 
1668 aa  572  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0410873  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  37.84 
 
 
6889 aa  566  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  38.16 
 
 
4136 aa  568  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2033  amino acid adenylation domain protein  35.35 
 
 
1740 aa  566  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  36.49 
 
 
3432 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  37.73 
 
 
5149 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  38.22 
 
 
5953 aa  560  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  34.39 
 
 
2033 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  35.54 
 
 
4531 aa  558  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  34.57 
 
 
3308 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  38.54 
 
 
3629 aa  552  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  33.4 
 
 
2867 aa  552  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  37.13 
 
 
8646 aa  549  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  31.67 
 
 
3086 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  36.9 
 
 
3404 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  31.57 
 
 
3086 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  34.35 
 
 
1142 aa  546  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  33.94 
 
 
3498 aa  545  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  38.17 
 
 
1839 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  36.17 
 
 
2370 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  34.29 
 
 
4502 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  31.84 
 
 
1870 aa  539  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  32.02 
 
 
1556 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  36.31 
 
 
4478 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  36.97 
 
 
5596 aa  538  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  37.69 
 
 
3328 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  37.94 
 
 
6072 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  34.54 
 
 
2845 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  31.65 
 
 
1870 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  37.69 
 
 
3352 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  37.92 
 
 
6006 aa  536  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  37.74 
 
 
6081 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  36.09 
 
 
4383 aa  533  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  31.65 
 
 
1556 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  32.14 
 
 
2791 aa  526  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  32.87 
 
 
1550 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  37.94 
 
 
1769 aa  518  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0353  amino acid adenylation domain-containing protein  36.77 
 
 
1054 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0224507  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  35.05 
 
 
5213 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4894  amino acid adenylation domain-containing protein  38.09 
 
 
1083 aa  516  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950239  normal  0.0263577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  36.09 
 
 
2154 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  34.86 
 
 
3176 aa  516  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  35.28 
 
 
3432 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  34.61 
 
 
3348 aa  515  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  34.08 
 
 
5926 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  32.11 
 
 
2006 aa  512  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  36.81 
 
 
7310 aa  512  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  31.96 
 
 
3291 aa  510  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  35.84 
 
 
5328 aa  512  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  36.51 
 
 
1776 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2201  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  37.38 
 
 
2106 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  34.61 
 
 
3291 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  33.09 
 
 
2571 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  36.03 
 
 
4882 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  34.78 
 
 
2448 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  33.09 
 
 
2571 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  35.34 
 
 
2151 aa  505  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  33.94 
 
 
1753 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  33.43 
 
 
1578 aa  506  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  35.14 
 
 
3639 aa  506  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  34.31 
 
 
2419 aa  501  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1749  amino acid adenylation domain protein  36.24 
 
 
1199 aa  500  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.82306  normal  0.0351239 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7311  peptide synthetase  34.64 
 
 
2183 aa  497  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  33.75 
 
 
13537 aa  499  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  35.01 
 
 
3002 aa  498  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  29.92 
 
 
2156 aa  499  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4417  amino acid adenylation domain-containing protein  36.58 
 
 
1104 aa  497  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.543215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  32.01 
 
 
7168 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  34.75 
 
 
6661 aa  493  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4891  amino acid adenylation domain-containing protein  37.08 
 
 
1104 aa  496  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0706407  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1874  amino acid adenylation domain-containing protein  32.94 
 
 
1553 aa  494  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  36.42 
 
 
2125 aa  492  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  30.92 
 
 
2752 aa  489  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  30.73 
 
 
2156 aa  491  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  36.69 
 
 
4037 aa  493  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  32.69 
 
 
2664 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  37.41 
 
 
4489 aa  492  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  32.69 
 
 
2395 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  35.69 
 
 
8914 aa  492  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  33.03 
 
 
5929 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  33.67 
 
 
9498 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>