More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4318 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  100 
 
 		 317 aa  628  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  91.91 
 
 		 309 aa  567  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  91.91 
 
 		 309 aa  568  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  71.74 
 
 		 301 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  69.49 
 
 		 302 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  68.25 
 
 		 304 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  49.33 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  51.27 
 
 		 305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  49.82 
 
 		 301 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  48.5 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  44.16 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  45.15 
 
 		 271 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  46.45 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  46.79 
 
 		 316 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  45.93 
 
 		 333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  46.57 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  44.24 
 
 		 311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  43.32 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  46 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  42.57 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  47.33 
 
 		 331 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  43.81 
 
 		 310 aa  229  6e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  40.07 
 
 		 312 aa  228  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 		 345 aa  227  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  40.98 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  39.06 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  40.28 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  39.55 
 
 		 303 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  37.79 
 
 		 305 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  40.55 
 
 		 272 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  38.6 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  38.66 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  36.23 
 
 		 277 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  35.93 
 
 		 271 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  31.71 
 
 		 281 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3682  aldo/keto reductase  32.31 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3181  aldo/keto reductase  31.89 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770886 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1602  aldo/keto reductase  26.6 
 
 		 281 aa  87  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1156  aldo/keto reductase  32.34 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721286  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2217  aldo/keto reductase  30.43 
 
 		 283 aa  86.7  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3081  aldo/keto reductase  30.56 
 
 		 277 aa  85.9  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  28.53 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  27.95 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0784  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.62 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.756682  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2579  aldo/keto reductase  30.34 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  27.65 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.93 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0329  aldo/keto reductase  32.08 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1997  aldo/keto reductase  29.2 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4577  aldo/keto reductase  26.27 
 
 		 353 aa  82.4  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.194058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  30.08 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  29.53 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  28.01 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2824  putative aldo/keto reductase  30.73 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2292  aldo/keto reductase  32.17 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5863  aldo/keto reductase  30.71 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  30.03 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0033  aldo/keto reductase  33.2 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  26.37 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2146  aldo/keto reductase  27.8 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0715  aldo/keto reductase  32.31 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  26.79 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4055  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0449  aldo/keto reductase  31.2 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2505  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.57 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00223283  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0764  aldo/keto reductase  30.86 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421466 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0755  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.73 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.181791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2449  aldo/keto reductase  29.59 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000271935 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  26.26 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2991  aldo/keto reductase  30.18 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  29.5 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20030  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31.16 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  27.74 
 
 		 358 aa  79  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01750  predicted oxidoreductase  32.18 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.725881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1861  aldo/keto reductase  32.18 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000447998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01738  hypothetical protein  32.18 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1851  aldo/keto reductase  32.18 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0581012  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  27.2 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  27.34 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2362  aldo/keto reductase  28.07 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.167956 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1866  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.18 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00718625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  29.33 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1699  aldo/keto reductase  32.82 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  23.7 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  30.23 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5799  aldo/keto reductase  29.89 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4714  oxidoreductase  30.43 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  27.49 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  27.18 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  26.67 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53850  oxidoreductase  29.92 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  27.48 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  28.69 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1101  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.89 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.16541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  28.81 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  27.24 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  27.43 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0948  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.87 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0952  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.89 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0319  aldo/keto reductase  28.29 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>