76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2419 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  100 
 
 
168 aa  334  3e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  41.67 
 
 
158 aa  109  2e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  42.96 
 
 
157 aa  107  7e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  45.65 
 
 
161 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  41.72 
 
 
166 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  45.16 
 
 
157 aa  101  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  37.67 
 
 
178 aa  99.8  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  42.96 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  40.26 
 
 
173 aa  95.1  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  36.64 
 
 
136 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  35.67 
 
 
181 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  40 
 
 
175 aa  91.3  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  39.22 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  40.38 
 
 
176 aa  89  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  39.33 
 
 
179 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  35.11 
 
 
138 aa  85.1  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  35.11 
 
 
138 aa  85.1  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  40 
 
 
179 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  31.48 
 
 
162 aa  84  1e-15  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  35.15 
 
 
174 aa  83.6  1e-15  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  36.57 
 
 
138 aa  82.8  2e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  39.73 
 
 
187 aa  82  4e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  39.52 
 
 
135 aa  80.9  8e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  35.82 
 
 
138 aa  80.5  1e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  3.6824e-06  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  37.5 
 
 
176 aa  80.1  1e-14  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  35.07 
 
 
138 aa  79.7  2e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  35.07 
 
 
138 aa  79.7  2e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  39.73 
 
 
183 aa  79.3  2e-14  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  35.07 
 
 
138 aa  79.7  2e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  35.07 
 
 
138 aa  79.7  2e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  35.07 
 
 
138 aa  79.7  2e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  30.92 
 
 
168 aa  78.6  3e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  34.62 
 
 
138 aa  76.6  1e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  34.33 
 
 
138 aa  77  1e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  35.07 
 
 
138 aa  76.3  2e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  32.31 
 
 
145 aa  75.5  3e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  31.76 
 
 
176 aa  74.7  5e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  31.76 
 
 
176 aa  74.7  5e-13  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  27.56 
 
 
147 aa  74.3  8e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  31.21 
 
 
177 aa  73.2  1e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  31.69 
 
 
138 aa  73.9  1e-12  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  33.08 
 
 
138 aa  73.2  2e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  33.08 
 
 
138 aa  73.2  2e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  37.09 
 
 
183 aa  71.6  5e-12  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  35.14 
 
 
181 aa  71.2  6e-12  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  30.63 
 
 
184 aa  70.1  1e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  33.97 
 
 
176 aa  69.7  2e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  36.99 
 
 
178 aa  69.3  2e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  30.41 
 
 
177 aa  69.7  2e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  32.88 
 
 
176 aa  67.8  7e-11  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  32.88 
 
 
176 aa  67.4  8e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  31.78 
 
 
144 aa  67.4  8e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  31.06 
 
 
176 aa  67.4  9e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  32.56 
 
 
140 aa  63.5  1e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  28.46 
 
 
144 aa  60.5  1e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  34.48 
 
 
185 aa  59.7  2e-08  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  31.78 
 
 
144 aa  58.5  4e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2010  hypothetical protein  29.23 
 
 
146 aa  55.8  3e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132855  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2105  hypothetical protein  29.23 
 
 
146 aa  55.8  3e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1657  hypothetical protein  29.23 
 
 
146 aa  55.8  3e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0702  hypothetical protein  29.23 
 
 
146 aa  55.8  3e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0519  hypothetical protein  29.23 
 
 
146 aa  55.8  3e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0592  hypothetical protein  29.23 
 
 
146 aa  55.8  3e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0756  hypothetical protein  29.23 
 
 
146 aa  55.8  3e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299244  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  34 
 
 
195 aa  54.7  6e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  24.44 
 
 
149 aa  53.5  1e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  27.42 
 
 
146 aa  51.6  5e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  26.72 
 
 
177 aa  49.7  2e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  28.05 
 
 
167 aa  49.7  2e-05  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2761  hypothetical protein  28.68 
 
 
143 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.264134  normal  0.221278 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2353  hypothetical protein  25.19 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2345  hypothetical protein  25.19 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0639664 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2306  hypothetical protein  25.19 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121889  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  26.67 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  25.66 
 
 
177 aa  42.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2614  hypothetical protein  24.44 
 
 
195 aa  40.8  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>