More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1420 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  69.85 
 
 
480 aa  635    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1420  putative oxidoreductase protein  100 
 
 
468 aa  933    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00835956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  68.09 
 
 
477 aa  649    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  69.92 
 
 
474 aa  649    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  69.13 
 
 
477 aa  647    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  70.49 
 
 
473 aa  644    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  70.34 
 
 
489 aa  654    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.66 
 
 
476 aa  635    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  72.39 
 
 
472 aa  631  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  67.55 
 
 
502 aa  627  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.74 
 
 
472 aa  619  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  64.27 
 
 
474 aa  590  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.45 
 
 
472 aa  585  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.18 
 
 
473 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  63.75 
 
 
473 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.18 
 
 
473 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  64.24 
 
 
470 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  63.33 
 
 
473 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  63.38 
 
 
472 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  63.46 
 
 
475 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  63.54 
 
 
473 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  63.6 
 
 
472 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  63.54 
 
 
473 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  63.38 
 
 
470 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  63.75 
 
 
473 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  62.74 
 
 
470 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  62.9 
 
 
473 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  62.9 
 
 
473 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  64.24 
 
 
472 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  63.11 
 
 
524 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  62.9 
 
 
473 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  62.9 
 
 
473 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  62.9 
 
 
473 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  62.9 
 
 
473 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.68 
 
 
472 aa  540  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  60.17 
 
 
472 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.19 
 
 
519 aa  524  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3006  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.47 
 
 
474 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  57.05 
 
 
468 aa  509  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  53.94 
 
 
468 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0546  FAD linked oxidase domain protein  49.36 
 
 
478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470259  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5308  FAD linked oxidase domain protein  57.48 
 
 
484 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.683932  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  50.21 
 
 
470 aa  450  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0975  FAD dependent oxidoreductase  48.72 
 
 
476 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  50.21 
 
 
470 aa  449  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0593  FAD linked oxidase domain protein  49.47 
 
 
475 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272743  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.32 
 
 
470 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  50.74 
 
 
475 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.64 
 
 
471 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.3 
 
 
483 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  51.8 
 
 
475 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.87 
 
 
477 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.18 
 
 
481 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  50.21 
 
 
489 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  49.15 
 
 
476 aa  431  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0307  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.75 
 
 
479 aa  429  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  50 
 
 
475 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.5 
 
 
474 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0442  FAD linked oxidase-like  52.12 
 
 
478 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  50 
 
 
478 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3118  FAD linked oxidase domain protein  55.74 
 
 
469 aa  422  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.624021  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  52.99 
 
 
478 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  49.89 
 
 
474 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  48.52 
 
 
480 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  47.55 
 
 
475 aa  415  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2117  putative D-lactate dehydrogenase  51.93 
 
 
471 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.07 
 
 
489 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  48.94 
 
 
472 aa  411  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1049  FAD linked oxidase-like protein  49.47 
 
 
474 aa  410  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538289  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  49.26 
 
 
470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  49.35 
 
 
470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0390  FAD-binding protein  44.26 
 
 
469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.04 
 
 
481 aa  403  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.97 
 
 
462 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  49.25 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  46.68 
 
 
483 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  47.99 
 
 
489 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  48.82 
 
 
464 aa  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5003  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.34 
 
 
477 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.541494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.14 
 
 
464 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  46.38 
 
 
480 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4691  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.73 
 
 
475 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3672  FAD linked oxidase domain protein  49.79 
 
 
484 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357048  normal  0.686407 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2127  putative oxidoreductase  45.15 
 
 
465 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421585  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0979  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.16 
 
 
491 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.1 
 
 
473 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2485  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.18 
 
 
479 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0928797  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6324  FAD linked oxidase domain protein  44.04 
 
 
471 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0789269  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4478  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.01 
 
 
465 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408304  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2327  FAD linked oxidase-like  50.11 
 
 
471 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.352966  normal  0.977128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2364  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.43 
 
 
496 aa  364  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0138  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.83 
 
 
506 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529634  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.57 
 
 
480 aa  362  6e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  45.11 
 
 
487 aa  362  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0214  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.11 
 
 
465 aa  362  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0158  FAD linked oxidase domain protein  49.33 
 
 
465 aa  362  1e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3146  FAD linked oxidase-like  46.49 
 
 
463 aa  360  3e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3474  FAD linked oxidase domain-containing protein  50 
 
 
483 aa  360  4e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.641437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3782  FAD linked oxidase domain protein  50 
 
 
483 aa  356  5e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2796  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.96 
 
 
498 aa  346  5e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>