24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8057 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8057  putative membrane protein with short-chain dehydrogenase/reductase  100 
 
 		 263 aa  551  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0787  hypothetical protein  47.9 
 
 		 271 aa  241  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2889  fatty acid hydroxylase  47.93 
 
 		 272 aa  234  8e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00520579  normal  0.0784368 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3325  hypothetical protein  45.45 
 
 		 277 aa  228  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.038125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3702  fatty acid hydroxylase  40.08 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3129  Fatty acid hydroxylase  37.09 
 
 		 381 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 371 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3072  hypothetical protein  33.33 
 
 		 371 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2018  hypothetical protein  33.33 
 
 		 371 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1041  hypothetical protein  33.98 
 
 		 367 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.117784  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1328  putative lipoprotein  33.98 
 
 		 367 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3199  putative lipoprotein  33.98 
 
 		 367 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.160296  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2308  putative lipoprotein  33.98 
 
 		 367 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37130  hypothetical protein  35.19 
 
 		 378 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000362882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3184  hypothetical protein  35.68 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0636163  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2307  hypothetical protein  33.17 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0975  hypothetical protein  32.69 
 
 		 369 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727204  normal  0.153799 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2399  fatty acid hydroxylase  35.05 
 
 		 223 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2974  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2669  hypothetical protein  28.5 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110076  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2760  fatty acid hydroxylase  28.5 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2854  fatty acid hydroxylase  28.5 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286921  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2648  hypothetical protein  29.63 
 
 		 228 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437546  normal  0.57129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0498  fatty acid hydroxylase  27.37 
 
 		 220 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1223  hemolysin III family channel protein  25.56 
 
 		 518 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743924  normal  0.559819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>