41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7734 on replicon NC_011888
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011888  Mnod_7734  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  141  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7051  hypothetical protein  76.36 
 
 		 81 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  52.83 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0393  hypothetical protein  45.76 
 
 		 73 aa  64.3  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.509195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1535  phage transcriptional regulator, AlpA  49.12 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1284  hypothetical protein  43.64 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0195028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  49.06 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  52.94 
 
 		 77 aa  50.1  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  50.98 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2014  hypothetical protein  47.46 
 
 		 89 aa  47.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1818  hypothetical protein  52.94 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1723  hypothetical protein  40.85 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3111  hypothetical protein  41.82 
 
 		 62 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  52.08 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0859  putative transcriptional regulator, MerR family  45.9 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  44.07 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1678  hypothetical protein  35 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7430  hypothetical protein  43.33 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2980  hypothetical protein  48 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4915  hypothetical protein  45.1 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4829  hypothetical protein  45.1 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0479763  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1568  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 		 78 aa  42.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1262  hypothetical protein  51.92 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23900  MerR family regulatory protein  45.24 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0883926  normal  0.115779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4449  hypothetical protein  41.18 
 
 		 65 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2785  hypothetical protein  58.06 
 
 		 66 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407412 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  43.14 
 
 		 251 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2038  hypothetical protein  45.45 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  49.06 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4165  hypothetical protein  48.15 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0794  phage transcriptional regulator, AlpA  35.59 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4319  hypothetical protein  44.44 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1229  phage transcriptional regulator, AlpA  39.39 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.470338  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  41.94 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3400  excisionase/Xis, DNA-binding  34.48 
 
 		 67 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149044  normal  0.941733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>