34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4427 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4427  UspA domain protein  100 
 
 
167 aa  326  1e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3395  UspA domain-containing protein  90.42 
 
 
167 aa  265  3e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.251638 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0297  UspA domain-containing protein  57.76 
 
 
168 aa  174  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.637126  normal  0.0141888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4036  hypothetical protein  52.76 
 
 
163 aa  168  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0141  hypothetical protein  50.62 
 
 
162 aa  158  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0015  hypothetical protein  50 
 
 
164 aa  151  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0940017  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0008  hypothetical protein  47.53 
 
 
164 aa  147  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0035  UspA domain-containing protein  49.06 
 
 
163 aa  147  1e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329999  hitchhiker  1.51739e-05 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3610  UspA domain-containing protein  50.62 
 
 
168 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0135  hypothetical protein  50.62 
 
 
179 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0216796  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0460  hypothetical protein  49.38 
 
 
164 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0429  Universal stress protein  47.24 
 
 
163 aa  137  8e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0037  UspA domain protein  46.63 
 
 
163 aa  135  3e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0039  hypothetical protein  47.85 
 
 
164 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.389129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0025  UspA domain protein  46.91 
 
 
163 aa  133  1e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.83625  normal  0.406465 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0154  UspA domain-containing protein  45.06 
 
 
162 aa  133  1e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0248  hypothetical protein  46.3 
 
 
164 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0458  UspA  45.4 
 
 
164 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0584  hypothetical protein  48.77 
 
 
164 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.355702  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0867  hypothetical protein  44.67 
 
 
151 aa  122  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0751448 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2278  UspA domain-containing protein  41.61 
 
 
151 aa  119  1e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377159  normal  0.574601 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0890  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 
151 aa  119  1e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622697  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2838  hypothetical protein  44 
 
 
151 aa  113  1e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00794322  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2501  hypothetical protein  38.61 
 
 
173 aa  108  2e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3730  hypothetical protein  41.33 
 
 
151 aa  105  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.808369 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2215  hypothetical protein  40.3 
 
 
134 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3027  hypothetical protein  40.13 
 
 
158 aa  101  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0532  UspA domain-containing protein  42.25 
 
 
151 aa  99  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206586  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3532  hypothetical protein  39.22 
 
 
185 aa  94.7  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.053335  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1947  hypothetical protein  38.93 
 
 
152 aa  64.3  7e-10  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.869369  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1234  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  34.67 
 
 
151 aa  55.5  4e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1368  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 
151 aa  50.1  1e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131997  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 
147 aa  45.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  25.17 
 
 
149 aa  41.6  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>