More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3911 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7616  protein of unknown function DUF21  98.8 
 
 
418 aa  810    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3911  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
418 aa  822    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  78.18 
 
 
443 aa  658    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  71.22 
 
 
440 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2174  protein of unknown function DUF21  70.32 
 
 
404 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2493  protein of unknown function DUF21  70.07 
 
 
404 aa  557  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4162  protein of unknown function DUF21  71.46 
 
 
440 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2723  protein of unknown function DUF21  64.34 
 
 
443 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2388  protein of unknown function DUF21  63.37 
 
 
442 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2477  protein of unknown function DUF21  61.78 
 
 
439 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0798586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2234  hypothetical protein  61.15 
 
 
443 aa  510  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840085  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2217  CBS domain-containing protein  68.78 
 
 
365 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.332679 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4594  hypothetical protein  57.93 
 
 
442 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1590  hemolysins and related proteins  53.85 
 
 
436 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.727705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4103  protein of unknown function DUF21  39.9 
 
 
442 aa  313  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110623 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  44.34 
 
 
431 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  40.58 
 
 
446 aa  295  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  42.16 
 
 
446 aa  292  6e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  38.26 
 
 
446 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  40.19 
 
 
430 aa  289  7e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  37.08 
 
 
437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  40.77 
 
 
439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  40 
 
 
442 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  35.39 
 
 
447 aa  272  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  36.67 
 
 
437 aa  272  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  39.05 
 
 
437 aa  271  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  37.59 
 
 
442 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  38.37 
 
 
433 aa  271  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  37.74 
 
 
428 aa  266  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  36.45 
 
 
440 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  37.56 
 
 
436 aa  264  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  37.44 
 
 
439 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  39.33 
 
 
443 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  33.57 
 
 
434 aa  261  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  37.41 
 
 
436 aa  258  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  34.29 
 
 
437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  33.5 
 
 
428 aa  254  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  36.25 
 
 
438 aa  253  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  36.63 
 
 
432 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3532  hypothetical protein  38.03 
 
 
455 aa  252  9.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.94 
 
 
442 aa  251  1e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  36.64 
 
 
432 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  36.64 
 
 
432 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  37.98 
 
 
432 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  36.64 
 
 
432 aa  250  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  35.34 
 
 
440 aa  250  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  36.63 
 
 
432 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  36.17 
 
 
433 aa  249  7e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.87 
 
 
425 aa  249  9e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  35.15 
 
 
442 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  35.95 
 
 
430 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.87 
 
 
432 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  34.92 
 
 
442 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  34.68 
 
 
442 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  34.12 
 
 
440 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  34.92 
 
 
442 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  34.68 
 
 
442 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  35.87 
 
 
432 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  34.44 
 
 
442 aa  246  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  34.44 
 
 
442 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  34.44 
 
 
435 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  34.44 
 
 
442 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  38.53 
 
 
434 aa  246  6.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  35.15 
 
 
443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  35.15 
 
 
443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  33.73 
 
 
435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  33.73 
 
 
439 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  33.9 
 
 
428 aa  243  5e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  36.12 
 
 
430 aa  243  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  33.89 
 
 
435 aa  243  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  34.2 
 
 
443 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  34.83 
 
 
448 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0455  conserved hypothetical protein, putative efflux protein (DUF21 domain protein)  35.78 
 
 
456 aa  241  1e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.844865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  35.15 
 
 
441 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  33.18 
 
 
435 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  33.18 
 
 
435 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  33.18 
 
 
435 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  33.98 
 
 
446 aa  241  2e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  33.18 
 
 
435 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  33.41 
 
 
435 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  37.8 
 
 
432 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  33.41 
 
 
435 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  36.73 
 
 
432 aa  240  4e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  32.94 
 
 
435 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  32.94 
 
 
435 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  34.61 
 
 
460 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  35.34 
 
 
443 aa  239  9e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  33.97 
 
 
443 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  34.69 
 
 
456 aa  238  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  33.89 
 
 
443 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1889  protein of unknown function DUF21  37.11 
 
 
464 aa  236  4e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483019  normal  0.437772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  34.36 
 
 
454 aa  235  9e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  33.65 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  35.06 
 
 
444 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  33.65 
 
 
451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  33.65 
 
 
451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  33.65 
 
 
451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  35.18 
 
 
446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  34.43 
 
 
441 aa  234  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  35.15 
 
 
458 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>