212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0124 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0124  transcriptional regulator, MucR family  100 
 
 		 137 aa  277  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4660  transcriptional regulator, MucR family  73.64 
 
 		 139 aa  205  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20016  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  57.89 
 
 		 166 aa  158  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1808  transcriptional regulator, MucR family  56.45 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4253  transcriptional regulator, MucR family  60.33 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0549  transcriptional regulator, MucR family  57.94 
 
 		 147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5073  transcriptional regulator, MucR family  59.35 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5932  MucR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 145 aa  151  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3684  transcriptional regulator, MucR family  55.38 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8754  transcriptional regulator, MucR family  60.17 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  55.38 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8789  transcriptional regulator, MucR family  55.81 
 
 		 147 aa  151  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292559  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6541  transcriptional regulator, MucR family  56.15 
 
 		 144 aa  150  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  55.93 
 
 		 164 aa  150  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  59.02 
 
 		 171 aa  150  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  56.92 
 
 		 173 aa  150  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5563  MucR family transcriptional regulator  56.59 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2999  transcriptional regulator, MucR family  57.26 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2484  transcriptional regulator, MucR family  59.84 
 
 		 134 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4087  transcriptional regulator, MucR family  56.15 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3845  transcriptional regulator, MucR family  56.35 
 
 		 135 aa  148  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  55.65 
 
 		 166 aa  148  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2091  transcriptional regulator, MucR family  58.68 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2620  transcriptional regulator, MucR family  54.62 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.297322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1890  MucR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6742  MucR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3559  transcriptional regulator, MucR family  59.35 
 
 		 144 aa  148  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1006  MucR family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 144 aa  147  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4973  transcriptional regulator, MucR family  58.59 
 
 		 160 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  55.65 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6580  MucR family transcriptional regulator  57.98 
 
 		 133 aa  145  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  52.99 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4730  MucR family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 145 aa  145  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6298  MucR family transcriptional regulator  59.84 
 
 		 142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  54.47 
 
 		 164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3346  MucR family transcriptional regulator  52.8 
 
 		 163 aa  144  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0065  MucR family transcriptional regulator  55.12 
 
 		 133 aa  143  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5488  MucR family transcriptional regulator  56.3 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622801  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7402  transcriptional regulator, MucR family  54.76 
 
 		 133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0608  MucR family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 166 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0460505 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  52.38 
 
 		 158 aa  137  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4944  MucR family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5626  transcriptional regulator, MucR family  58.27 
 
 		 133 aa  135  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.63695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4097  MucR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4116  MucR family transcriptional regulator  56 
 
 		 140 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1357  MucR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 141 aa  133  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.067604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3504  transcriptional regulator, MucR family  57.14 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 174 aa  131  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 168 aa  131  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0587  MucR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0109398  hitchhiker  0.00472777 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  52.52 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  52.1 
 
 		 155 aa  130  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1029  MucR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  50 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3787  ROSMUCR transcriptional regulator  49.62 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  52.07 
 
 		 137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  48.82 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  50.78 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  50.76 
 
 		 137 aa  127  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4422  MucR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 145 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.705801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 138 aa  126  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  49.22 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5207  MucR family transcriptional regulator  51.2 
 
 		 183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  49.22 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 174 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2100  transcriptional regulator, MucR family  54.96 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6743  MucR family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328928  normal  0.300512 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6371  MucR family transcriptional regulator  50 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  48.76 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2834  ROSMUCR transcriptional regulator  50.38 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3060  transcriptional regulator, MucR family  50.38 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1282  transcriptional regulator, MucR family  52.21 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135766  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0075  MucR family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4938  transcriptional regulator, MucR family  46.4 
 
 		 176 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686756  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 138 aa  123  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4474  ROSMUCR transcriptional regulator  46.4 
 
 		 176 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2952  transcriptional regulator, MucR family  50.38 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5564  MucR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3766  MucR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0985  MucR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.933762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  50.41 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  50 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1802  MucR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1538  MucR family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4988  transcriptional regulator, MucR family  45.6 
 
 		 177 aa  121  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103901  normal  0.173335 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8284  transcriptional regulator, MucR family  50.81 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647815  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0569  Ros/MucR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 142 aa  120  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.402998  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0570  Ros/MucR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4896  MucR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 180 aa  121  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127609  hitchhiker  0.00352911 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  49.58 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  46.46 
 
 		 175 aa  120  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  46.46 
 
 		 171 aa  120  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  46.46 
 
 		 175 aa  120  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1889  MucR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 137 aa  120  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5627  transcriptional regulator, MucR family  47.83 
 
 		 174 aa  120  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.698408  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  48.03 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>