24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5096 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5096  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0823672  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5184  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5475  hypothetical protein  99.55 
 
 
223 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5715  hypothetical protein  80.65 
 
 
227 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1102  hypothetical protein  79.82 
 
 
224 aa  354  5.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3661  hypothetical protein  62.5 
 
 
231 aa  261  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598103  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0569  hypothetical protein  61.46 
 
 
210 aa  259  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0387  hypothetical protein  63.59 
 
 
212 aa  257  9e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8251  hypothetical protein  59.11 
 
 
210 aa  244  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2796  hypothetical protein  59.72 
 
 
222 aa  244  9e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.551909  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2147  hypothetical protein  62.69 
 
 
205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2876  hypothetical protein  56.16 
 
 
210 aa  237  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3869  hypothetical protein  52.44 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0013  hypothetical protein  60 
 
 
190 aa  229  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0009  hypothetical protein  61 
 
 
205 aa  224  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198242  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3597  hypothetical protein  57.3 
 
 
235 aa  199  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2490  hypothetical protein  50.79 
 
 
204 aa  197  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144778  normal  0.0598589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2009  hypothetical protein  50.77 
 
 
200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.567228  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2587  hypothetical protein  47.12 
 
 
204 aa  191  9e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3506  hypothetical protein  41.46 
 
 
209 aa  175  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.906839 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0492  hypothetical protein  40.3 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0865  hypothetical protein  24.08 
 
 
314 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107689 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2745  hypothetical protein  26.44 
 
 
378 aa  45.1  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  46.34 
 
 
415 aa  43.5  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>