More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0040 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0030  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  99.05 
 
 
738 aa  1451  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.327823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4270  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.11 
 
 
740 aa  964  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008368  normal  0.652694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2376  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.1 
 
 
745 aa  915  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67767  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0049  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
738 aa  1462  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138566  normal  0.0651954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0040  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  100 
 
 
738 aa  1462  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0403  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.87 
 
 
737 aa  455  1e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0366  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  38.88 
 
 
730 aa  452  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235849  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0376  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.88 
 
 
730 aa  452  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.262889  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.88 
 
 
730 aa  452  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353074  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0335  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.16 
 
 
728 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0801  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.96 
 
 
736 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2624  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.96 
 
 
751 aa  440  1e-122  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.487043  normal  0.289465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3998  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.28 
 
 
734 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183743  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2822  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.71 
 
 
750 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.42354  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2177  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.2 
 
 
732 aa  430  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  1.63847e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10275  acyl-CoA dehydrogenase fadE6  37.6 
 
 
731 aa  426  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0482205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1467  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  38.16 
 
 
733 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859778  normal  0.817011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5097  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38 
 
 
717 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.167108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5311  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.04 
 
 
716 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.17244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1460  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.04 
 
 
718 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4712  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  38 
 
 
717 aa  386  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4798  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38 
 
 
717 aa  386  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3494  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.18 
 
 
739 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2148  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.28 
 
 
725 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0210  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.75 
 
 
722 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0201  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  36.75 
 
 
722 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0441  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.08 
 
 
729 aa  372  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56016  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2795  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.3 
 
 
684 aa  369  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67003  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0190  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.02 
 
 
722 aa  369  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2603  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.03 
 
 
719 aa  365  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.035645  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4022  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.5 
 
 
716 aa  364  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.98053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13606  acyl-CoA dehydrogenase fadE34  36.78 
 
 
711 aa  358  2e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.531914 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0226  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.56 
 
 
733 aa  350  6e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.25373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6713  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  43.43 
 
 
744 aa  349  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289113  normal  0.281332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0882  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.21 
 
 
726 aa  348  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13078  acyl-CoA dehydrogenase fadE22  35.03 
 
 
721 aa  339  1e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.273933  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3797  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.74 
 
 
694 aa  333  5e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1314  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.76 
 
 
775 aa  227  5e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3605  acyl-CoA dehydrogenase-like  38.28 
 
 
415 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.75816  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.17 
 
 
415 aa  216  1e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.337795  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2198  acyl-CoA dehydrogenase-like  37.39 
 
 
413 aa  211  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659729  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1688  Acyl-CoA dehydrogenase-like  37.94 
 
 
415 aa  210  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78575  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3604  acyl-CoA dehydrogenase-like  37.1 
 
 
414 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0502899  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7117  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.82 
 
 
414 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7116  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.89 
 
 
415 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3397  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.12 
 
 
403 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00717177  decreased coverage  0.00584794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1910  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.35 
 
 
414 aa  207  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1689  Acyl-CoA dehydrogenase-like  36.76 
 
 
415 aa  207  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.777163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3426  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.42 
 
 
407 aa  204  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0960  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.84 
 
 
378 aa  204  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.489478  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0803  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.92 
 
 
378 aa  201  4e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2698  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.48 
 
 
390 aa  199  2e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.79248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1475  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.6 
 
 
397 aa  199  2e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0513972  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2008  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.11 
 
 
833 aa  197  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.23 
 
 
411 aa  196  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5287  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.57 
 
 
374 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  0.272331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2706  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.57 
 
 
383 aa  195  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0953492  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.27 
 
 
396 aa  194  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25619  normal  0.0238889 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0965  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.81 
 
 
409 aa  194  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7781  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.73 
 
 
395 aa  193  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2813  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.98 
 
 
380 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6825  dehydrogenase family protein  37.39 
 
 
393 aa  191  6e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4613  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.24 
 
 
394 aa  191  6e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1805  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.67 
 
 
397 aa  190  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.337752  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4695  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  36.15 
 
 
389 aa  190  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0252616  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4781  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.15 
 
 
389 aa  190  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.98 
 
 
381 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2309  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.55 
 
 
411 aa  190  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1861  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.16 
 
 
395 aa  189  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1604  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.45 
 
 
432 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.39 
 
 
396 aa  187  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.08 
 
 
393 aa  187  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16750  acyl-CoA dehydrogenase  38.98 
 
 
403 aa  187  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.73205  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4779  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.6 
 
 
386 aa  186  1e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0320  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.54 
 
 
370 aa  186  1e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.25734  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4313  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.86 
 
 
397 aa  186  1e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.815664  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3838  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.02 
 
 
385 aa  186  2e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13595  acyl-CoA dehydrogenase fadE31  36.15 
 
 
377 aa  186  2e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000120639  normal  0.258893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2334  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.67 
 
 
400 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.615469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1060  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.88 
 
 
397 aa  184  4e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.596056  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5080  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.64 
 
 
389 aa  184  5e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.302814 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1468  Acyl-CoA dehydrogenase  31.53 
 
 
716 aa  184  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4485  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.34 
 
 
386 aa  184  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4096  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.16 
 
 
396 aa  184  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624184  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4398  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  35.34 
 
 
386 aa  184  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5300  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.76 
 
 
402 aa  183  9e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.712748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4361  acyl-CoA dehydrogenase  34.4 
 
 
381 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2769  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.52 
 
 
393 aa  181  5e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51100  acyl-CoA dehydrogenase  36.87 
 
 
381 aa  181  5e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.28895  decreased coverage  7.6859e-08 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1985  acyl-CoA dehydrogenase  35.88 
 
 
381 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4137  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.21 
 
 
381 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0701  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.61 
 
 
397 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.249551  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0736  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.8 
 
 
403 aa  178  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.453117  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1636  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  36.26 
 
 
401 aa  178  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1479  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.96 
 
 
374 aa  177  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4064  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.18 
 
 
390 aa  177  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0394  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.2 
 
 
398 aa  177  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.254856  normal  0.326104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.23 
 
 
362 aa  176  1e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3819  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  36.47 
 
 
348 aa  176  2e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5149  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.22 
 
 
393 aa  176  2e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.0612186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>