More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0634 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 204 aa  424  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  34.67 
 
 		 192 aa  117  9e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  32.6 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  31.3 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  31.17 
 
 		 248 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  30.84 
 
 		 222 aa  101  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0580  hypothetical protein  30.53 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.894879  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  33.66 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003398  queuosine Biosynthesis QueE Radical SAM  31.44 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  32.89 
 
 		 222 aa  98.2  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6259  Radical SAM domain protein  30.93 
 
 		 230 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  34.8 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  31.6 
 
 		 246 aa  97.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  29.15 
 
 		 245 aa  97.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  32.16 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  33.04 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  34.31 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  30.87 
 
 		 224 aa  95.1  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  30.26 
 
 		 222 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  30.39 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  31.74 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  29.39 
 
 		 222 aa  93.2  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  32.35 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  32.42 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1394  hypothetical protein  32.42 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  35.21 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 217 aa  92  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  28.82 
 
 		 225 aa  92  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  29.52 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  32.27 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  32.27 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  31.86 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  29.65 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  28.95 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  33.18 
 
 		 210 aa  89.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  28.95 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  28.95 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1825  radical activating enzyme  29.96 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.40401  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  31.44 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  33.17 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7690  hypothetical protein  29.07 
 
 		 235 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  28.44 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  29.77 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02385  hypothetical protein  29.36 
 
 		 216 aa  88.6  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06800  hypothetical protein  31.16 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0516243  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  31.39 
 
 		 210 aa  88.6  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  32.16 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  30.29 
 
 		 216 aa  88.6  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  30.26 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  34.38 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  31.4 
 
 		 233 aa  86.7  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  31.48 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  30.3 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  29.65 
 
 		 223 aa  85.9  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  30.84 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  34.6 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  31.43 
 
 		 227 aa  85.5  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  34.78 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  30.4 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  31.39 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  31.39 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 223 aa  85.1  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  31.39 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  31.39 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 223 aa  85.1  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  31.39 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 223 aa  85.1  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  27.95 
 
 		 222 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  31.39 
 
 		 210 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  30.4 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  30.4 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  30.4 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  29.52 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  30.4 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  29.52 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  29.52 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  30.4 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  30.4 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  27.95 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  30.4 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  29.52 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  30.26 
 
 		 223 aa  84.7  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  30.4 
 
 		 223 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  31.39 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6747  radical SAM domain-containing protein  33.48 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  29.52 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  32.27 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  30.94 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  29.49 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  34.78 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  27.95 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  30.59 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2177  radical SAM domain-containing protein  31.7 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  27.95 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0794  hypothetical protein  31.56 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  30.22 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  30.94 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0017  radical SAM domain-containing protein  33.03 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.015175  normal  0.941948 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  29.36 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  30.94 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>