53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0003 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0003  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  830  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00559809  unclonable  1.11615e-08 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0135  hypothetical protein  41.31 
 
 
443 aa  257  3e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0584774  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0154  hypothetical protein  44.63 
 
 
445 aa  256  7e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2661  hypothetical protein  36.08 
 
 
429 aa  240  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1240  hypothetical protein  31.34 
 
 
438 aa  233  6e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0689849  hitchhiker  0.000177876 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3330  hypothetical protein  34.16 
 
 
428 aa  222  9e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7439  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  28.99 
 
 
445 aa  212  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2471  5-methylcytosine restriction system component- like protein  30.5 
 
 
428 aa  206  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.248512 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3669  putative 5-methylcytosine restriction system component  29.44 
 
 
436 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1862  hypothetical protein  30.36 
 
 
431 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0176  hypothetical protein  46.51 
 
 
288 aa  199  1e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3724  hypothetical protein  31.18 
 
 
418 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1654  hypothetical protein  31.28 
 
 
424 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4619  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  29.97 
 
 
436 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000187053  hitchhiker  6.28519e-08 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4726  hypothetical protein  29.64 
 
 
422 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1981  hypothetical protein  31.04 
 
 
428 aa  180  3e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2911  hypothetical protein  29.56 
 
 
435 aa  174  3e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4531  hypothetical protein  34.02 
 
 
267 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.814257  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1591  hypothetical protein  26.92 
 
 
429 aa  135  1e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0993  hypothetical protein  30.81 
 
 
437 aa  133  7e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.235646  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3671  hypothetical protein  30.27 
 
 
273 aa  132  1e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3309  IQ calmodulin-binding- domain protein  26.92 
 
 
426 aa  129  8e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3470  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  30.77 
 
 
423 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00801853  normal  0.511219 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1011  5-methylcytosine restriction system component-like protein  28.8 
 
 
460 aa  116  7e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  1.44218e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1299  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  24.35 
 
 
437 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217939  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1703  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  26.54 
 
 
421 aa  95.1  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3270  hypothetical protein  27.22 
 
 
453 aa  93.6  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0179938  normal  0.335413 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0227  hypothetical protein  24.53 
 
 
514 aa  79  1e-13  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0395217  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2402  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  22.46 
 
 
431 aa  78.2  2e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0253  hypothetical protein  24.53 
 
 
498 aa  74.7  3e-12  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.13037  normal  0.68079 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1386  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  21.12 
 
 
411 aa  65.1  2e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0806  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  24.55 
 
 
383 aa  65.5  2e-09  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0894928  hitchhiker  5.3751e-05 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6960  hypothetical protein  22.61 
 
 
405 aa  64.7  3e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00920086  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3197  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  22.41 
 
 
446 aa  64.3  3e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0398257  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05460  McrBC 5-methylcytosine restriction system component  23.62 
 
 
393 aa  60.1  7e-08  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0350  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  28.93 
 
 
687 aa  60.1  7e-08  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0783  5-methylcytosine restriction system component- like protein  25.74 
 
 
409 aa  60.1  7e-08  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0863  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  19.75 
 
 
418 aa  56.6  7e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0976  hypothetical protein  21.15 
 
 
430 aa  55.5  2e-06  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0362174 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1213  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  24.28 
 
 
351 aa  55.5  2e-06  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.816052 
 
 
-
 
NC_002950  PG0972  hypothetical protein  32.05 
 
 
431 aa  53.5  7e-06  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.241373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0437  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  36.76 
 
 
164 aa  53.1  8e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  hitchhiker  2.58291e-12 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3753  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  28.83 
 
 
351 aa  52.4  1e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.537146  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3652  5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC  22.39 
 
 
348 aa  50.8  4e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04211  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrC  22.39 
 
 
348 aa  50.4  5e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04175  hypothetical protein  22.39 
 
 
348 aa  50.4  5e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7821  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  21.34 
 
 
406 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0879  hypothetical protein  22.22 
 
 
459 aa  45.8  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0515666  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1561  5-methylcytosine restriction system component- like protein  23.41 
 
 
451 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2667  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  20.11 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0475891  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1283  5-methylcytosine restriction system component- like protein  25.37 
 
 
350 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.03694e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0952  hypothetical protein  23.04 
 
 
441 aa  45.1  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3300  5-methylcytosine restriction system component- like protein  21.83 
 
 
398 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>