32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0732 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0732  abortive infection protein  100 
 
 
236 aa  466  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4420  abortive infection protein  29 
 
 
218 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2139  abortive infection protein  33.06 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.317172  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  29.51 
 
 
242 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1677  abortive infection protein  26.07 
 
 
228 aa  53.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  37.25 
 
 
241 aa  52.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  37.23 
 
 
279 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  36.17 
 
 
279 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3240  abortive infection protein  30.49 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.11341 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  30.9 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3247  Abortive infection protein  32.94 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  34.12 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  34.26 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  34.41 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  27.16 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0004  abortive infection protein  36.36 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00759738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  28.69 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  26.72 
 
 
257 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2896  Abortive infection protein  35.63 
 
 
279 aa  43.5  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.142954  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  26.81 
 
 
269 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2015  CAAX amino terminal protease family protein  34.33 
 
 
266 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  35.78 
 
 
259 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  35.78 
 
 
259 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2748  abortive infection protein  36.67 
 
 
220 aa  42.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  25 
 
 
313 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  25 
 
 
337 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2327  abortive infection protein  33.7 
 
 
225 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  38.04 
 
 
277 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  25.64 
 
 
337 aa  42  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  30.95 
 
 
256 aa  42  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  25 
 
 
313 aa  42  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  30.59 
 
 
267 aa  41.6  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>