39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3078 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_3078  phage major capsid protein, HK97  100 
 
 		 282 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2910  phage major capsid protein, HK97  97.52 
 
 		 281 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2954  phage major capsid protein, HK97  97.52 
 
 		 281 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.624972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  64.86 
 
 		 279 aa  343  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  29.97 
 
 		 409 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  27.66 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  26.95 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  27.18 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  26.79 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  25.91 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  26.62 
 
 		 400 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3805  phage major capsid protein, HK97  26.22 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3878  phage major capsid protein, HK97  26.22 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4311  phage major capsid protein, HK97  26.22 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101318  normal  0.740598 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  25.61 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1753  phage major capsid protein, HK97  25.84 
 
 		 435 aa  62.4  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.357661 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  24.75 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  25.52 
 
 		 392 aa  58.9  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  26.09 
 
 		 514 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  32.2 
 
 		 781 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  26.32 
 
 		 403 aa  52.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  28.01 
 
 		 409 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  23.9 
 
 		 490 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  24.86 
 
 		 389 aa  49.3  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  29.94 
 
 		 446 aa  48.9  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3579  phage major capsid protein, HK97  27.2 
 
 		 411 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.978109  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  23.17 
 
 		 427 aa  46.6  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  23.17 
 
 		 427 aa  46.6  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  23.17 
 
 		 427 aa  46.6  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  23.7 
 
 		 382 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3394  HK97 family phage major capsid protein  25 
 
 		 397 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000537798 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  23.7 
 
 		 382 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  23 
 
 		 437 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  23.11 
 
 		 386 aa  43.5  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  25.66 
 
 		 380 aa  42.7  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  24 
 
 		 624 aa  42.7  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  24 
 
 		 624 aa  42.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  24 
 
 		 624 aa  42.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  24 
 
 		 624 aa  42.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>