28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0178 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0178  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000306154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2941  hypothetical protein  40 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2085  hypothetical protein  32.5 
 
 
126 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.97593  normal  0.098717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1727  lysozyme inhibitor  32.99 
 
 
109 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0360001  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1544  lysozyme inhibitor  32.99 
 
 
107 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.412708  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1617  lysozyme inhibitor  32.99 
 
 
107 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26226  normal  0.640497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1557  lysozyme inhibitor  32.99 
 
 
109 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.833119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53040  lysozyme inhibitor  40.3 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4650  lysozyme inhibitor  40.3 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1373  hypothetical protein  44.68 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1896  lysozyme inhibitor  37.1 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1990  lysozyme inhibitor  38.71 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01599  hypothetical protein  38.71 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0866  putative lipoprotein  34.38 
 
 
108 aa  42.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1831  lysozyme inhibitor  38.71 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.927133  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01609  predicted lipoprotein  38.71 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1849  lysozyme inhibitor  38.71 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000107016  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1715  lysozyme inhibitor  38.71 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.19796  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0544  hypothetical protein  35.37 
 
 
154 aa  42.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3299  hypothetical protein  30.95 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.103854  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2001  putative lipoprotein  38.71 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000221904  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1809  lysozyme inhibitor  35.48 
 
 
122 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0953992  hitchhiker  0.00103718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2215  putative periplasmic protein  35 
 
 
125 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1560  lysozyme inhibitor  37.1 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.31 
 
 
241 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2351  lysozyme inhibitor  35.48 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0205035  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1247  hypothetical protein  29.76 
 
 
122 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.670192 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1692  putative lipoprotein  32 
 
 
98 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.155098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>