More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl137 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl137  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
129 aa  258  2e-68  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0682  30S ribosomal protein S8  87.6 
 
 
129 aa  229  7.000000000000001e-60  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  57.36 
 
 
132 aa  155  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3891  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 
135 aa  155  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3909  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
135 aa  154  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239493  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  60.31 
 
 
133 aa  153  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  59.69 
 
 
132 aa  152  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  59.38 
 
 
131 aa  152  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4301  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
135 aa  152  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660154  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  57.36 
 
 
133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  60.47 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 
133 aa  151  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  57.36 
 
 
132 aa  150  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  55.81 
 
 
133 aa  150  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  61.54 
 
 
132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  58.02 
 
 
131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  56.59 
 
 
132 aa  150  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 
132 aa  149  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  57.36 
 
 
132 aa  149  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 
132 aa  149  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
135 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  59.69 
 
 
132 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  60.47 
 
 
132 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  60.47 
 
 
132 aa  148  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  55.04 
 
 
132 aa  147  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  56.59 
 
 
132 aa  147  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  58.14 
 
 
132 aa  147  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  55.81 
 
 
132 aa  146  8e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 
133 aa  146  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  58.78 
 
 
131 aa  146  9e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0615  ribosomal protein S8  54.69 
 
 
129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  59.69 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  58.59 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  55.81 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  51.88 
 
 
136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04120  SSU ribosomal protein S8P  54.26 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  56.59 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  58.91 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  58.91 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  58.91 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  58.91 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  57.03 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  58.91 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  58.91 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  55.81 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17030  SSU ribosomal protein S8P  55.81 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158451  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  56.92 
 
 
133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  58.91 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2962  30S ribosomal protein S8  55.04 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00876753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  58.91 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  58.91 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  58.91 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  54.26 
 
 
132 aa  144  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  60.16 
 
 
132 aa  145  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1100  30S ribosomal protein S8  55.04 
 
 
132 aa  144  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  58.59 
 
 
132 aa  144  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  59.69 
 
 
134 aa  145  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29600  SSU ribosomal protein S8P  55.81 
 
 
132 aa  145  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  58.14 
 
 
132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 
132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 
132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 
132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  57.36 
 
 
132 aa  144  6e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  53.49 
 
 
132 aa  143  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2674  30S ribosomal protein S8  54.26 
 
 
132 aa  143  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  54.26 
 
 
132 aa  143  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0596  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 
136 aa  143  9e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  53.49 
 
 
132 aa  142  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2999  30S ribosomal protein S8  55.81 
 
 
133 aa  142  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  hitchhiker  0.00660095 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  56.59 
 
 
132 aa  142  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  57.03 
 
 
131 aa  142  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05790  ribosomal protein S8  55.3 
 
 
132 aa  141  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  59.69 
 
 
132 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  53.49 
 
 
133 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23660  SSU ribosomal protein S8P  54.26 
 
 
132 aa  142  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.06742  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  53.91 
 
 
132 aa  142  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5033  30S ribosomal protein S8  52.71 
 
 
132 aa  141  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000369377  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  55.47 
 
 
132 aa  141  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  52.71 
 
 
132 aa  141  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316434  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  57.36 
 
 
132 aa  141  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6035  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 
135 aa  140  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5138  ribosomal protein S8  54.26 
 
 
132 aa  140  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0320  SSU ribosomal protein S8P  53.73 
 
 
134 aa  140  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00355814 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  53.97 
 
 
130 aa  140  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2243  30S ribosomal protein S8  55.81 
 
 
126 aa  140  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0125456  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3283  30S ribosomal protein S8  55.91 
 
 
131 aa  140  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000196614  hitchhiker  0.00000244921 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2936  30S ribosomal protein S8  55.91 
 
 
131 aa  140  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000152051  hitchhiker  0.000000826655 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  53.54 
 
 
131 aa  140  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1161  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 
132 aa  140  8e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000284312  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  55.04 
 
 
132 aa  140  9e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3005  30S ribosomal protein S8  55.12 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00104823  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1147  ribosomal protein S8  53.08 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000686706  hitchhiker  0.00453997 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0412  ribosomal protein S8  53.38 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  55.81 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  53.54 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  53.54 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  53.54 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  53.54 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  53.54 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  53.54 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>