27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1590 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  730    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  91.85 
 
 		 368 aa  677    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  98.64 
 
 		 367 aa  718    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  60.51 
 
 		 368 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3249  hypothetical protein  54.52 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4444  hypothetical protein  53.44 
 
 		 374 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3559  hypothetical protein  30.51 
 
 		 343 aa  142  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  34.47 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3536  hypothetical protein  30.59 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0317173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  30.07 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0948  hypothetical protein  27.2 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0839  hypothetical protein  27.66 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1181  hypothetical protein  27.51 
 
 		 394 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3224  hypothetical protein  30.94 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  30.21 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5213  hypothetical protein  24.26 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0672  hypothetical protein  27.65 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.745104  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3577  hypothetical protein  30 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0395057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3870  hypothetical protein  31.38 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.13922 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0581  hypothetical protein  23.45 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1585  hypothetical protein  25.13 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399212 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  25.49 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0991  hypothetical protein  25.83 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1913  hypothetical protein  27.48 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1989  hypothetical protein  27.48 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3086  hypothetical protein  29.35 
 
 		 325 aa  50.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2943  hypothetical protein  25.71 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0604603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>