17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4397 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4397  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  458  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0261514  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8614  hypothetical protein  62.62 
 
 		 254 aa  240  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0401  hypothetical protein  41.89 
 
 		 229 aa  94.7  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612069  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4479  hypothetical protein  34.43 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6318  hypothetical protein  35.58 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3372  integrase family protein  32.77 
 
 		 601 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0029  hypothetical protein  29.58 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4139  integrase family protein  31.91 
 
 		 642 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217214  hitchhiker  0.0000125149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  25.81 
 
 		 643 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1977  phage integrase family protein  25 
 
 		 617 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0697  integrase family protein  21.66 
 
 		 618 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2408  integrase (int)  25 
 
 		 617 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.71715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5939  hypothetical protein  30.09 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1597  integrase family protein  33.33 
 
 		 602 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.754785  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2044  hypothetical protein  29.13 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.385074  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2403  phage integrase  26.45 
 
 		 444 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000050364  decreased coverage  0.00000383819 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3466  integrase family protein  27.45 
 
 		 644 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>