13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0401 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0401  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612069  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8614  hypothetical protein  42.11 
 
 		 254 aa  89  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4397  hypothetical protein  42.11 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0261514  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4479  hypothetical protein  36.97 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1031  hypothetical protein  38.83 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2403  phage integrase  29.41 
 
 		 444 aa  48.5  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000050364  decreased coverage  0.00000383819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  30.7 
 
 		 643 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3466  integrase family protein  29.03 
 
 		 644 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0697  integrase family protein  29.2 
 
 		 618 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2408  integrase (int)  31.73 
 
 		 617 aa  45.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.71715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1977  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 617 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1388  hypothetical protein  29.91 
 
 		 208 aa  42.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6318  hypothetical protein  29.69 
 
 		 272 aa  42  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>