13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4479 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4479  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5105  hypothetical protein  35.37 
 
 
203 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0131259  normal  0.0245513 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8614  hypothetical protein  33.17 
 
 
254 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0401  hypothetical protein  36.97 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612069  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1031  hypothetical protein  26.6 
 
 
249 aa  55.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.269343  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4397  hypothetical protein  35.16 
 
 
228 aa  55.1  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0261514  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0029  hypothetical protein  33.01 
 
 
199 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4263  hypothetical protein  31.63 
 
 
125 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0800  hypothetical protein  30.89 
 
 
217 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25800  hypothetical protein  35.96 
 
 
195 aa  45.4  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4718  hypothetical protein  27.97 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0482007  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3372  integrase family protein  29.2 
 
 
601 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5507  hypothetical protein  37.5 
 
 
194 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.813818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>