19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8614 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8614  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4397  hypothetical protein  62.62 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0261514  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0401  hypothetical protein  42.11 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612069  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4479  hypothetical protein  33.17 
 
 		 227 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0029  hypothetical protein  34.86 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2408  integrase (int)  28.23 
 
 		 617 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.71715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4139  integrase family protein  28.7 
 
 		 642 aa  52.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217214  hitchhiker  0.0000125149 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1977  phage integrase family protein  32.04 
 
 		 617 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6318  hypothetical protein  36.54 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0697  integrase family protein  26.67 
 
 		 618 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1177  hypothetical protein  37.93 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3372  integrase family protein  32.41 
 
 		 601 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1597  integrase family protein  28.89 
 
 		 602 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.754785  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2044  hypothetical protein  31.4 
 
 		 208 aa  45.8  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.385074  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2403  phage integrase  28.7 
 
 		 444 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000050364  decreased coverage  0.00000383819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2363  hypothetical protein  30.65 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484815  hitchhiker  0.000017265 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1388  hypothetical protein  31.45 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06790  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  31.25 
 
 		 605 aa  42.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.118542  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  29.52 
 
 		 643 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>