15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2044 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2044  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  417  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.385074  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1388  hypothetical protein  69.71 
 
 
208 aa  297  6e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2363  hypothetical protein  68.27 
 
 
208 aa  279  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484815  hitchhiker  0.000017265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3372  integrase family protein  44.24 
 
 
601 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1977  phage integrase family protein  51.24 
 
 
617 aa  116  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602154  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0697  integrase family protein  48.72 
 
 
618 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2408  integrase (int)  50.41 
 
 
617 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.71715  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  43.48 
 
 
643 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4139  integrase family protein  45.08 
 
 
642 aa  104  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217214  hitchhiker  0.0000125149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1597  integrase family protein  38.33 
 
 
602 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.754785  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2403  phage integrase  38.33 
 
 
444 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000050364  decreased coverage  0.00000383819 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3466  integrase family protein  39.13 
 
 
644 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6318  hypothetical protein  33.64 
 
 
272 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8614  hypothetical protein  31.4 
 
 
254 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4397  hypothetical protein  30.21 
 
 
228 aa  41.6  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0261514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>