14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2363 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2363  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  418  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484815  hitchhiker  0.000017265 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1388  hypothetical protein  92.79 
 
 		 208 aa  388  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2044  hypothetical protein  68.27 
 
 		 208 aa  278  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.385074  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1977  phage integrase family protein  51.28 
 
 		 617 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0697  integrase family protein  51.28 
 
 		 618 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2408  integrase (int)  49.57 
 
 		 617 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.71715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3372  integrase family protein  45 
 
 		 601 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4139  integrase family protein  50.46 
 
 		 642 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217214  hitchhiker  0.0000125149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  40 
 
 		 643 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1597  integrase family protein  38.33 
 
 		 602 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.754785  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2403  phage integrase  38.33 
 
 		 444 aa  99.8  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000050364  decreased coverage  0.00000383819 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3466  integrase family protein  39.13 
 
 		 644 aa  99  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6318  hypothetical protein  33.02 
 
 		 272 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8614  hypothetical protein  30.65 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>