26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0550 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0550  hypothetical protein  100 
 
 
773 aa  1538    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.00000581827  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2413  hypothetical protein  38.86 
 
 
909 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.273323  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2263  hypothetical protein  38.46 
 
 
862 aa  421  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.716746  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2513  hypothetical protein  38.35 
 
 
847 aa  394  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0522  hypothetical protein  39.16 
 
 
941 aa  366  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.057808  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0065  hypothetical protein  36.94 
 
 
754 aa  270  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000275591  decreased coverage  0.0000022772 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2759  hypothetical protein  30.25 
 
 
892 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.257016  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1308  hypothetical protein  39.26 
 
 
361 aa  179  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0304738  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  27.44 
 
 
1231 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2457  hypothetical protein  52.48 
 
 
186 aa  96.3  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1431  PEGA domain-containing protein  46.15 
 
 
326 aa  90.9  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.075762  decreased coverage  0.0000710587 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1535  hypothetical protein  26.95 
 
 
811 aa  90.5  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0148901  hitchhiker  0.00829639 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1180  hypothetical protein  30.59 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.111365 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1964  hypothetical protein  26.73 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.833026 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0595  hypothetical protein  39.69 
 
 
196 aa  79.3  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2148  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  64.7  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.43566  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0859  hypothetical protein  26.05 
 
 
593 aa  63.9  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.837601  normal  0.245097 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2025  hypothetical protein  37.07 
 
 
205 aa  62  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0865236 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  25.56 
 
 
1292 aa  58.5  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0631  hypothetical protein  30.32 
 
 
254 aa  49.7  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.606141  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2460  hypothetical protein  26.19 
 
 
334 aa  49.7  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1183  hypothetical protein  36.54 
 
 
194 aa  48.9  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.780381  normal  0.0653972 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1197  PEGA domain-containing protein  26.98 
 
 
364 aa  48.9  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.258799  hitchhiker  0.00873035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1185  hypothetical protein  29.61 
 
 
226 aa  46.6  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0191124 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1240  hypothetical protein  30.23 
 
 
236 aa  46.6  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.757551  normal  0.0435016 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1178  hypothetical protein  41.18 
 
 
207 aa  45.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.26968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>