42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1134 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1134  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  545  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  48.47 
 
 		 396 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1146  CAAX amino terminal protease family protein  48.72 
 
 		 291 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  40.25 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_679  CAAX amino terminal protease  29.29 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2968  Abortive infection protein  27.17 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.337339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0699  abortive infection protein  30.08 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0773  CAAX amino terminal protease family protein  29.55 
 
 		 246 aa  78.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  32.89 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5653  abortive infection protein  35.23 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.122774 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  33.73 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  33.71 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  29.75 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  39.19 
 
 		 362 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0151  Abortive infection protein  29.29 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  32.26 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  35.23 
 
 		 267 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5184  hypothetical protein  26.55 
 
 		 280 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0151548 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1846  Abortive infection protein  32 
 
 		 274 aa  45.8  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  34.44 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  25.15 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  34.44 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3955  abortive infection protein  33.6 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2184  abortive infection protein  32.18 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  32.97 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0152  CAAX protease family protein  31.62 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  32.97 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  32.97 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1191  CAAX protease family protein  31.62 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1161  abortive infection protein  36.59 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.422922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2167  abortive infection protein  41.67 
 
 		 193 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02490  Abortive infection protein  32.1 
 
 		 208 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1148  CAAX protease family protein  31.62 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.235437  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1659  Abortive infection protein  27.46 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  33.33 
 
 		 272 aa  42.7  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1408  CAAX protease family protein  31.62 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1494  caax protease family protein  31.62 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199735  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0430  CAAX protease family protein  31.62 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249831  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0011  CAAX protease family protein  31.62 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.603173  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1503  Abortive infection protein  28.91 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.209578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0359  Abortive infection protein  32.39 
 
 		 321 aa  42.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  30.59 
 
 		 292 aa  42.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>