58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0647 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0647  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  100 
 
 
235 aa  475  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3174  NADPH-dependent F420 reductase  38.43 
 
 
216 aa  160  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1659  NADPH-dependent F420 reductase  38.43 
 
 
216 aa  156  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.451421  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1428  NADPH-dependent F420 reductase  35.81 
 
 
220 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1799  NADPH-dependent F420 reductase  36.68 
 
 
216 aa  149  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252536  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1974  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  36.76 
 
 
242 aa  146  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0022  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  40.2 
 
 
225 aa  135  4e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3495  NADPH-dependent F420 reductase  37.23 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1562  NADPH-dependent F420 reductase  36.8 
 
 
222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0303  NADPH-dependent F420 reductase  36.36 
 
 
222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.18628  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1025  NADPH-dependent F420 reductase  39.7 
 
 
200 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3944  NADPH-dependent F420 reductase  37.66 
 
 
222 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.184955  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0240  NADPH-dependent F420 reductase  37.07 
 
 
222 aa  121  9e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745076  normal  0.341645 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0196  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  38.73 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000865826  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  36.71 
 
 
223 aa  119  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  35.62 
 
 
223 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0765  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  37.07 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00505079 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0798  NADPH-dependent F420 reductase  33.9 
 
 
223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0821593  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  34.44 
 
 
222 aa  111  9e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  36.7 
 
 
222 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.47 
 
 
223 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1646  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.33 
 
 
229 aa  98.2  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  33.94 
 
 
226 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  34.4 
 
 
232 aa  92.8  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3403  NADPH-dependent F420 reductase  32.29 
 
 
231 aa  91.7  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  33.49 
 
 
223 aa  88.6  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4256  NADPH-dependent F420 reductase  33.19 
 
 
226 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0062  NADPH-dependent F420 reductase  33.48 
 
 
244 aa  86.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4044  NADPH-dependent F420 reductase  33.64 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  32.88 
 
 
231 aa  85.5  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0327  NADPH-dependent F420 reductase  30.34 
 
 
222 aa  85.1  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.03 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1119  NADPH-dependent F420 reductase  30.6 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0180  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.81 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.220411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1760  NADPH-dependent F420 reductase  33.5 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.00319562 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  34.78 
 
 
243 aa  75.1  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  30.95 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1231  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.52 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  32.41 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1414  NADPH-dependent F420 reductase  30.58 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  31.07 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  30 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1400  NADPH-dependent F420 reductase  32.02 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0816  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.92 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428849  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  30 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  30.28 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3589  NADPH-dependent F420 reductase  28.9 
 
 
232 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000495197 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.48 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  26.28 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.57 
 
 
216 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0718  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.72 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479373 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.52 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2493  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.25 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0762  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain-containing protein  30.71 
 
 
331 aa  42.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463537  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.07 
 
 
205 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.24 
 
 
210 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>