55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0826 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0826  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  284  4e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  33.64 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  28.24 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  35.54 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  28.35 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  25.9 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  29.93 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  28.32 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  30.37 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  27.5 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  28.57 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  24.82 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  30.93 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  31.58 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0797  hypothetical protein  29.2 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.437761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  27.93 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  25.6 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  27.18 
 
 		 176 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  29.91 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  29.03 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  25.23 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  24.82 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  26.97 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  26.4 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  25 
 
 		 166 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  25 
 
 		 176 aa  47  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  25.95 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5012  hypothetical protein  28.86 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  25.81 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  25.81 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  25 
 
 		 176 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  25.81 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  26.61 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  27.69 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  28.57 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  28.3 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  26.98 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  26.8 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  30.3 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  27.36 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0102  hypothetical protein  24.03 
 
 		 142 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  28.57 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  29.52 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  24.73 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  29.03 
 
 		 184 aa  40.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  25.23 
 
 		 168 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>