More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02074 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  100 
 
 
166 aa  333  9e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3734  redoxin  70.12 
 
 
164 aa  239  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085288  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1552  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  67.07 
 
 
168 aa  236  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108824  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1262  redoxin domain-containing protein  67.27 
 
 
165 aa  231  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.828642 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22170  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  65.45 
 
 
165 aa  228  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  59.39 
 
 
166 aa  211  5e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  60.48 
 
 
179 aa  208  3e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0346  Redoxin domain protein  58.18 
 
 
165 aa  207  5e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  58.18 
 
 
166 aa  206  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  60.74 
 
 
167 aa  202  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  60.74 
 
 
167 aa  202  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31810  thiol peroxidase  60.61 
 
 
165 aa  201  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230308  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0730  thiol peroxidase  58.43 
 
 
187 aa  201  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.543369 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1888  thiol peroxidase  58.43 
 
 
166 aa  200  7e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2704  thiol peroxidase  60 
 
 
165 aa  200  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0833  thiol peroxidase  56.63 
 
 
173 aa  198  2e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.734828  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11961  thiol peroxidase  56.71 
 
 
165 aa  198  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196708  normal  0.378209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  58.54 
 
 
165 aa  197  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2114  redoxin domain-containing protein  57.58 
 
 
165 aa  195  2e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1159  thiol peroxidase  59.64 
 
 
167 aa  194  4e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3507  thiol peroxidase  59.64 
 
 
167 aa  194  5e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  59.51 
 
 
167 aa  194  5e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3504  thiol peroxidase  59.64 
 
 
167 aa  194  5e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0426  thiol peroxidase  59.64 
 
 
167 aa  194  5e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1285  thiol peroxidase  59.64 
 
 
167 aa  194  5e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.850808  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2505  thiol peroxidase  59.64 
 
 
167 aa  194  5e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155608  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3279  thiol peroxidase  59.64 
 
 
167 aa  194  5e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2783  redoxin domain-containing protein  57.83 
 
 
167 aa  194  5e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2520  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  56.63 
 
 
166 aa  194  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0980441 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2481  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.79 
 
 
166 aa  193  8e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1240  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  58.43 
 
 
166 aa  193  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  60.84 
 
 
166 aa  192  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3469  thiol peroxidase  59.04 
 
 
167 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1133  Redoxin domain protein  53.99 
 
 
197 aa  191  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0528381  normal  0.881075 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0950  thiol peroxidase  53.01 
 
 
166 aa  191  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  60.61 
 
 
166 aa  191  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1535  thiol peroxidase  57.06 
 
 
168 aa  191  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  60.61 
 
 
166 aa  191  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  58.79 
 
 
166 aa  190  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01312  hypothetical protein  57.06 
 
 
168 aa  190  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2322  Redoxin domain protein  57.06 
 
 
168 aa  190  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1969  thiol peroxidase  57.06 
 
 
168 aa  190  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal  0.35715 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01301  thiol peroxidase  57.06 
 
 
168 aa  190  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1439  thiol peroxidase  57.06 
 
 
168 aa  190  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2301  thiol peroxidase  57.06 
 
 
168 aa  190  8e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1798  thiol peroxidase  57.06 
 
 
168 aa  190  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190801  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1768  thiol peroxidase  57.67 
 
 
167 aa  190  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  55.69 
 
 
187 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2140  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  54.82 
 
 
166 aa  189  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  6.63162e-11  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0570  redoxin domain-containing protein  57.23 
 
 
167 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.913258  hitchhiker  0.00016403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  58.18 
 
 
166 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0624  thiol peroxidase  54.22 
 
 
168 aa  189  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000437492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0601  redoxin domain-containing protein  57.23 
 
 
167 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1557  thiol peroxidase  56.44 
 
 
168 aa  188  3e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3684  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  56.63 
 
 
167 aa  188  3e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.484477  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0118  redoxin  57.23 
 
 
167 aa  188  3e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2328  redoxin domain-containing protein  56.02 
 
 
166 aa  188  3e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2752  thiol peroxidase  56.97 
 
 
166 aa  188  3e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  55.09 
 
 
167 aa  187  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  55.09 
 
 
167 aa  187  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15610  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  59.49 
 
 
161 aa  187  7e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0239273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2803  redoxin domain-containing protein  55.42 
 
 
166 aa  186  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.919062  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0527  redoxin domain-containing protein  55.42 
 
 
167 aa  186  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.790405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0503  redoxin domain-containing protein  55.42 
 
 
167 aa  186  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  56.63 
 
 
166 aa  186  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2151  thiol peroxidase  57.41 
 
 
168 aa  186  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1868  thiol peroxidase  55.21 
 
 
168 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.188696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1807  thiol peroxidase  55.21 
 
 
168 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2432  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  58.43 
 
 
166 aa  186  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607298  normal  0.399489 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3798  redoxin domain-containing protein  54.55 
 
 
165 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.247869  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06240  thiol peroxidase  53.61 
 
 
166 aa  185  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1806  thiol peroxidase  55.21 
 
 
168 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411429 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1468  thiol peroxidase  55.21 
 
 
168 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1650  thiol peroxidase  55.21 
 
 
168 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103223  hitchhiker  0.00495137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2185  redoxin domain-containing protein  54.82 
 
 
166 aa  184  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2603  thiol peroxidase  55.83 
 
 
167 aa  184  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3587  redoxin domain protein  54.22 
 
 
166 aa  182  1e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0532  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  55.83 
 
 
166 aa  182  2e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2321  thiol peroxidase  55.21 
 
 
167 aa  182  2e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1733  thiol peroxidase  55.83 
 
 
167 aa  181  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.777022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  53.05 
 
 
167 aa  181  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0841  redoxin domain-containing protein  49.7 
 
 
199 aa  181  4e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227128  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  53.01 
 
 
166 aa  176  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3254  thiol peroxidase  56.71 
 
 
165 aa  176  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345159  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  49.7 
 
 
166 aa  175  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  54.82 
 
 
166 aa  175  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.23 
 
 
165 aa  174  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  53.01 
 
 
166 aa  174  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0425  Redoxin domain protein  52.53 
 
 
166 aa  169  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  49.39 
 
 
163 aa  161  4e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  48.5 
 
 
172 aa  155  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1193  redoxin domain-containing protein  47.88 
 
 
165 aa  154  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2756  redoxin domain protein  47.27 
 
 
166 aa  154  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1717  Redoxin domain protein  44.31 
 
 
175 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  49.37 
 
 
166 aa  151  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  48.73 
 
 
166 aa  151  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  48.12 
 
 
171 aa  151  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  47.85 
 
 
232 aa  150  6e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  46.63 
 
 
164 aa  149  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  45.12 
 
 
166 aa  147  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>