42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4557 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  410  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  85.79 
 
 		 203 aa  328  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  54.14 
 
 		 241 aa  201  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  45.21 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  46.24 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  46.24 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  41.1 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  39.88 
 
 		 227 aa  128  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  38.69 
 
 		 178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  33.18 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  31.9 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  34.05 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  29.67 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  31.49 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  32.09 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  30.77 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  31.15 
 
 		 190 aa  92.8  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  31.1 
 
 		 169 aa  91.3  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  26.96 
 
 		 169 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  29.27 
 
 		 167 aa  84.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  27.11 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  28.31 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  28.31 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  25.9 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  26.83 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  29.27 
 
 		 177 aa  72  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  29.27 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  26.58 
 
 		 169 aa  67  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  27.44 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  27.44 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  28.03 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  27.88 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  25.14 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  26.9 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  24.1 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  25.44 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  22.86 
 
 		 167 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  24.24 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  24.16 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  26.39 
 
 		 168 aa  51.6  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0638  hypothetical protein  23.63 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2699  hypothetical protein  25.71 
 
 		 312 aa  42  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>