More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1459 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1459  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000394716  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0082  30S ribosomal protein S13  80.17 
 
 		 121 aa  198  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1883  30S ribosomal protein S13  79.34 
 
 		 121 aa  194  4.0000000000000005e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0618  30S ribosomal protein S13  77.24 
 
 		 123 aa  193  9e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000347  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0219  30S ribosomal protein S13  76.42 
 
 		 123 aa  190  7e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0440156  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2377  30S ribosomal protein S13  72.73 
 
 		 121 aa  183  8e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000483861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  74.38 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  74.38 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  74.38 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  73.55 
 
 		 121 aa  181  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  73.55 
 
 		 121 aa  181  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  73.55 
 
 		 121 aa  181  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  73.55 
 
 		 121 aa  181  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  73.55 
 
 		 121 aa  181  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  73.55 
 
 		 121 aa  181  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0314  30S ribosomal protein S13  76.58 
 
 		 115 aa  181  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  9.88789e-29 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  72.73 
 
 		 121 aa  180  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  75.21 
 
 		 121 aa  179  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  73.55 
 
 		 121 aa  177  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  71.07 
 
 		 121 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  71.9 
 
 		 121 aa  174  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  71.9 
 
 		 121 aa  174  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  71.07 
 
 		 121 aa  171  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  66.94 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  66.94 
 
 		 121 aa  164  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  66.94 
 
 		 121 aa  164  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  61.16 
 
 		 121 aa  160  7e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 122 aa  158  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 123 aa  158  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0672  30S ribosomal protein S13  60.33 
 
 		 121 aa  157  5e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 124 aa  157  6e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  156  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  156  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 123 aa  156  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 121 aa  155  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  63.28 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1550  ribosomal protein S13  65.18 
 
 		 114 aa  155  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  153  7e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 123 aa  153  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  66.67 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 123 aa  152  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 125 aa  152  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  61.16 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  62.81 
 
 		 123 aa  151  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0374  30S ribosomal protein S13  62.81 
 
 		 124 aa  150  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  63.11 
 
 		 122 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 123 aa  150  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  62.6 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2302  30S ribosomal protein S13  63.96 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1364  30S ribosomal protein S13  63.96 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 125 aa  147  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 125 aa  148  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0511  30S ribosomal protein S13  64.86 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0430719  normal  0.0101578 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0506  30S ribosomal protein S13  64.86 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00117339  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  146  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 126 aa  147  7e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  147  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  63.39 
 
 		 128 aa  146  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 125 aa  146  9e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0741  30S ribosomal protein S13  61.26 
 
 		 118 aa  146  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0141684  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 125 aa  145  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  63.39 
 
 		 128 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  63.39 
 
 		 128 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0351  30S ribosomal protein S13  58.97 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.069435  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  58.68 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2147  30S ribosomal protein S13  61.26 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0234905  normal  0.437789 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0521  30S ribosomal protein S13  58.97 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  unclonable  0.0000000000153746 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0447  30S ribosomal protein S13  63.96 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000202005  hitchhiker  0.00280445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  144  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 124 aa  144  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  62.83 
 
 		 127 aa  144  6e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  59.5 
 
 		 124 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0648  ribosomal protein S13  58.56 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.945062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4527  30S ribosomal protein S13  58.56 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0302  30S ribosomal protein S13  62.16 
 
 		 120 aa  142  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420412  hitchhiker  0.0000142456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1452  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0642708  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0081  30S ribosomal protein S13  60.36 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000227347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>