More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1072 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1072  peroxiredoxin  100 
 
 
187 aa  389  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000624433  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1450  peroxiredoxin  76.34 
 
 
189 aa  309  2e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000353338  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0908  peroxiredoxin  64.71 
 
 
187 aa  266  2e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000179552  normal  0.606862 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0602  peroxiredoxin  63.44 
 
 
188 aa  263  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25090  peroxiredoxin  63.64 
 
 
187 aa  259  1e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0502073  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0784  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  62.03 
 
 
187 aa  256  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0341  peroxiredoxin  60.43 
 
 
187 aa  251  5.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0119285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0476  peroxiredoxin  60.96 
 
 
187 aa  247  6e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0942  peroxiredoxin  57.22 
 
 
187 aa  238  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1407  peroxiredoxin  58.29 
 
 
187 aa  238  5e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0447  peroxiredoxin  55.61 
 
 
187 aa  231  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1125  peroxiredoxin  58.2 
 
 
188 aa  231  5e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0003  peroxiredoxin  53.48 
 
 
187 aa  228  3e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000147227 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2301  peroxiredoxin  57.22 
 
 
187 aa  228  5e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.701051  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21220  peroxiredoxin  54.55 
 
 
187 aa  227  8e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00898795  normal  0.214618 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2519  peroxiredoxin  55.61 
 
 
187 aa  224  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0849  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.76 
 
 
205 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3444  peroxiredoxin  53.76 
 
 
189 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3638  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.76 
 
 
189 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3517  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.76 
 
 
189 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0792  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.69 
 
 
189 aa  223  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.124423 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1102  peroxiredoxin  53.48 
 
 
187 aa  223  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.012958  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01110  peroxiredoxin  59.36 
 
 
187 aa  222  2e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0928  peroxiredoxin  53.23 
 
 
189 aa  221  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0896  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.23 
 
 
189 aa  221  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0522  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.08 
 
 
189 aa  221  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1833  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  55.61 
 
 
186 aa  221  4.9999999999999996e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00340072  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2095  alkyl hydroperoxide reductase protein  52.94 
 
 
187 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.216306 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3012  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.08 
 
 
189 aa  220  7e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1205  hypothetical protein  53.48 
 
 
187 aa  220  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  4.64987e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0315  peroxiredoxin  55.08 
 
 
187 aa  220  9e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00856528  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3730  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  53.48 
 
 
187 aa  219  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0618  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  55.06 
 
 
188 aa  220  9.999999999999999e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0440  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  54.01 
 
 
187 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0958  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  52.69 
 
 
189 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0330  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  54.01 
 
 
187 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0314  alkyl hydroperoxide reductase (peroxiredoxin)  54.01 
 
 
187 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0317  alkyl hydroperoxide reductase  54.01 
 
 
187 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0439  peroxiredoxin  54.01 
 
 
187 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3927  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  53.48 
 
 
187 aa  219  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4495  peroxiredoxin  54.01 
 
 
187 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0345  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  54.01 
 
 
187 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0377  peroxiredoxin  54.01 
 
 
187 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1797  putative alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  51.61 
 
 
188 aa  219  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0829  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  52.15 
 
 
189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.520161 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0801  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.15 
 
 
189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3222  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.15 
 
 
189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3501  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.48 
 
 
187 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3325  alkyl hydroperoxide reductase/Thiol specific antioxidant/Mal allergen  52.15 
 
 
189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4220  peroxiredoxin  53.48 
 
 
187 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.176986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5403  peroxiredoxin  52.94 
 
 
187 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123087  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0392  peroxiredoxin  54.01 
 
 
187 aa  219  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4926  peroxiredoxin  54.01 
 
 
187 aa  219  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1953  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.48 
 
 
187 aa  218  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0830467  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0325  peroxiredoxin  54.01 
 
 
187 aa  219  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3574  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  53.48 
 
 
187 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1965  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.41 
 
 
187 aa  218  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4717  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  54.24 
 
 
189 aa  218  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5072  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  53.48 
 
 
187 aa  218  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.911201  normal  0.100881 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0661  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  52.41 
 
 
187 aa  217  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0766  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  52.41 
 
 
187 aa  217  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.713597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45910  Alkyl hydroperoxide reductase  52.41 
 
 
187 aa  218  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3984  peroxiredoxin  52.94 
 
 
187 aa  217  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.682619  normal  0.347189 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2078  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.08 
 
 
188 aa  218  6e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0832179  normal  0.5898 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0647  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  52.41 
 
 
187 aa  217  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0705  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  52.41 
 
 
187 aa  217  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.129921 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0720  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  52.41 
 
 
187 aa  217  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3838  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.48 
 
 
187 aa  217  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3657  peroxiredoxin  52.94 
 
 
187 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1316  normal  0.64975 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3454  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  52.94 
 
 
187 aa  216  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2369  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  53.48 
 
 
187 aa  216  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0617  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  51.08 
 
 
189 aa  216  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4275  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.94 
 
 
187 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3432  peroxiredoxin  52.94 
 
 
187 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.54 
 
 
189 aa  217  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.956436  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0383  peroxiredoxin  55.08 
 
 
187 aa  216  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.126031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4091  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.94 
 
 
187 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00574  alkyl hydroperoxide reductase, C22 subunit  51.34 
 
 
187 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.355104  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3019  peroxiredoxin  51.34 
 
 
187 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0657  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  51.34 
 
 
187 aa  216  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0691  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  51.34 
 
 
187 aa  216  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.759293  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2975  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.48 
 
 
187 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.244311  normal  0.019621 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3187  peroxiredoxin  52.41 
 
 
187 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0626  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  51.34 
 
 
187 aa  216  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3038  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  51.34 
 
 
187 aa  216  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.783257  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2401  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.16 
 
 
190 aa  216  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.548664 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0626  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  51.34 
 
 
187 aa  216  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0519  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  51.34 
 
 
187 aa  216  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00563  hypothetical protein  51.34 
 
 
187 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04762  alkyl hydroperoxide reductase c22 protein  53.51 
 
 
185 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3256  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.94 
 
 
187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3534  peroxiredoxin  52.94 
 
 
187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.734574  normal  0.05332 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2439  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  52.94 
 
 
187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2882  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  53.48 
 
 
187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000958869  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1145  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  52.41 
 
 
187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.731724 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1926  alkyl hydroperoxide reductase, subunit c  52.41 
 
 
187 aa  214  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2139  peroxiredoxin  51.08 
 
 
188 aa  214  4e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.441627  hitchhiker  0.00203852 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2045  alkyl hydroperoxide reductase protein  52.94 
 
 
187 aa  214  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0667  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  52.94 
 
 
187 aa  214  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.830328  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0757  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  52.94 
 
 
187 aa  214  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>