23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0088 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0086  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  277  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0088  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  277  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.713807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0407  hypothetical protein  47.06 
 
 		 165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1902  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00660694  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1709  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.567805  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2717  hypothetical protein  40.19 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0262  PilT protein domain protein  36.52 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.423377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4992  hypothetical protein  31.29 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3076  hypothetical protein  27.46 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.130003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0062  hypothetical protein  29.17 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506925  normal  0.544054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3018  hypothetical protein  36.3 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13202  hypothetical protein  35.56 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00935579  normal  0.278062 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2207  hypothetical protein  35.65 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0485116  normal  0.147084 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0890  hypothetical protein  31.21 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.416652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0894  hypothetical protein  29.93 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0230  PilT domain-containing protein  28.28 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.874187 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13442  hypothetical protein  30 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0424  PilT domain-containing protein  29.66 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.437549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2877  PilT protein-like  31.62 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.013961  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3382  PilT protein domain protein  36.03 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.337564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0206  hypothetical protein  30.71 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00358255  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1327  hypothetical protein  31.08 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.668385 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0369  hypothetical protein  30 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.126404  normal  0.0369519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>