25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0076 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0074  chain length determinant family protein  100 
 
 		 336 aa  549  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0076  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 274 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.853299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1768  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.68 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0945  lipopolysaccharide biosynthesis  24.38 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0419  chain length determinant protein  21.69 
 
 		 370 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.554474  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.05 
 
 		 463 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1317  lipopolysaccharide biosynthesis  25.99 
 
 		 328 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0310451 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  30.36 
 
 		 740 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  29.46 
 
 		 740 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3033  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 		 320 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2841  lipopolysaccharide biosynthesis  27.27 
 
 		 326 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.500509  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1571  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.07 
 
 		 371 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.647884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2366  lipopolysaccharide biosynthesis  26.47 
 
 		 518 aa  45.8  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1384  lipopolysaccharide biosynthesis  25.28 
 
 		 324 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00868672 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22900  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 		 278 aa  45.8  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  39.19 
 
 		 797 aa  45.4  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00199  chain length determinant protein  39.66 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.971806  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0278  O-antigen length determinant protein  27.07 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  32.14 
 
 		 790 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3191  chain length determinant protein  25.84 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  34.72 
 
 		 753 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0795  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2541  lipopolysaccharide biosynthesis  26.4 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  32.47 
 
 		 747 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1674  lipopolysaccharide biosynthesis  48.57 
 
 		 364 aa  42  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>