More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3367 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 312 aa  619  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  65.74 
 
 		 292 aa  348  9e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  57.39 
 
 		 289 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2880  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  53.66 
 
 		 289 aa  285  9e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518579  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.28 
 
 		 289 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  54.17 
 
 		 285 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3278  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  53.04 
 
 		 330 aa  276  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  51.35 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.44 
 
 		 289 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  55.28 
 
 		 289 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1033  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.98 
 
 		 310 aa  275  6e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0667917 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  54.42 
 
 		 289 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2010  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  53.04 
 
 		 299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0121868  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0951  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  51.69 
 
 		 299 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  55.99 
 
 		 289 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  53.52 
 
 		 289 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  53.52 
 
 		 289 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  53.52 
 
 		 289 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  53.52 
 
 		 289 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  53.52 
 
 		 289 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.99 
 
 		 289 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.99 
 
 		 289 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  53.52 
 
 		 289 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  53.52 
 
 		 289 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  51.52 
 
 		 304 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  53.18 
 
 		 299 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  53.33 
 
 		 290 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1496  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.34 
 
 		 300 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  54.93 
 
 		 289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  51.39 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  51.93 
 
 		 283 aa  259  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  54.93 
 
 		 289 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  48.56 
 
 		 279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1566  Rhodanese domain protein  48 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.21 
 
 		 282 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  50.34 
 
 		 295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  51.93 
 
 		 284 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.29 
 
 		 285 aa  252  6e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  52.46 
 
 		 284 aa  252  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  50.34 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  52.43 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  50.86 
 
 		 296 aa  249  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1426  Rhodanese domain protein  46.59 
 
 		 276 aa  248  8e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.630889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1708  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.71 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  52.98 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  50.53 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  48.43 
 
 		 278 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  49.47 
 
 		 276 aa  235  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  49.31 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  49.28 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  49.47 
 
 		 284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.72 
 
 		 284 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.26 
 
 		 284 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  49.47 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  51.05 
 
 		 290 aa  230  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  48.42 
 
 		 284 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  48.77 
 
 		 284 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  48.87 
 
 		 285 aa  225  9e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  49.67 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  50.7 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  45.52 
 
 		 291 aa  218  7.999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.34 
 
 		 280 aa  218  8.999999999999998e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  48.21 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3515  thiosulfate sulfurtransferase  48.6 
 
 		 278 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.432298  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  45.2 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1776  Rhodanese domain protein  45.51 
 
 		 301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  43.11 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  45.42 
 
 		 280 aa  212  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  46.48 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  46.88 
 
 		 284 aa  209  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3608  Rhodanese domain protein  46.83 
 
 		 279 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0580281  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  48.01 
 
 		 687 aa  209  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  46.79 
 
 		 270 aa  208  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3673  Rhodanese domain protein  47.18 
 
 		 279 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  47.62 
 
 		 627 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1872  Rhodanese domain protein  40.43 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1846  Rhodanese domain protein  40.43 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.74 
 
 		 278 aa  205  9e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2623  rhodanese domain-containing protein  40.08 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  45.72 
 
 		 375 aa  203  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 278 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  40.07 
 
 		 276 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  47.45 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0764  Rhodanese domain protein  43.66 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  38.97 
 
 		 272 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3069  Rhodanese domain protein  48.24 
 
 		 277 aa  196  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3485  rhodanese domain-containing protein  38.87 
 
 		 278 aa  196  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  47.5 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2596  Rhodanese domain protein  47.33 
 
 		 282 aa  192  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  45.55 
 
 		 287 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3789  Rhodanese domain protein  44.26 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0279123  normal  0.459796 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0159  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.08 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0556  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.96 
 
 		 276 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  45.52 
 
 		 288 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  44.87 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29210  rhodanese-related sulfurtransferase  45.22 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.71 
 
 		 285 aa  186  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  39.08 
 
 		 272 aa  186  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0677  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  45.36 
 
 		 283 aa  185  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>