More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1389 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1389  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  100 
 
 
625 aa  1289  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2515  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  40.03 
 
 
643 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0685531 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.05 
 
 
634 aa  429  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.43 
 
 
628 aa  430  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2408  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38.43 
 
 
635 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38.99 
 
 
639 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.83 
 
 
646 aa  412  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0669  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38.33 
 
 
641 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0138  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.84 
 
 
631 aa  407  1e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0809158  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2519  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.83 
 
 
647 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.828783  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.56 
 
 
643 aa  401  1e-110  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.35 
 
 
638 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  37.79 
 
 
619 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3272  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  37.42 
 
 
642 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4005  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.84 
 
 
622 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.03 
 
 
637 aa  387  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.09 
 
 
625 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2327  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38.61 
 
 
629 aa  382  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.752356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.39 
 
 
634 aa  381  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3121  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.98 
 
 
641 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205444  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5298  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.32 
 
 
629 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.634266  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.25 
 
 
629 aa  372  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.33 
 
 
632 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.86 
 
 
629 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.18 
 
 
632 aa  369  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  2.88023e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.33 
 
 
635 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0508  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.37 
 
 
626 aa  365  1e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1919  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.55 
 
 
631 aa  363  8e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0596  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.22 
 
 
630 aa  362  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0793  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.01 
 
 
639 aa  362  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.716028 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  36.41 
 
 
606 aa  362  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4439  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.29 
 
 
634 aa  360  4e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.17 
 
 
629 aa  359  7e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411872  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0474  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.08 
 
 
628 aa  358  2e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4039  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.47 
 
 
633 aa  357  4e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354675  normal  0.528504 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.33 
 
 
633 aa  352  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.26358e-07  unclonable  6.28543e-25 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.89 
 
 
664 aa  352  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  32.17 
 
 
633 aa  350  4e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.00713e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.17 
 
 
633 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.60892e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.17 
 
 
633 aa  350  4e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.07333e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.17 
 
 
633 aa  350  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.17 
 
 
633 aa  350  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.33092e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.17 
 
 
633 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  7.47097e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  32.17 
 
 
633 aa  350  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.74005e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.17 
 
 
633 aa  350  4e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.49 
 
 
633 aa  350  5e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.97095e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.23 
 
 
619 aa  350  5e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0712  putative asparagine synthetase  34.98 
 
 
626 aa  349  7e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3874  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.56 
 
 
632 aa  349  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3751  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.76 
 
 
655 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1636  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.35 
 
 
643 aa  347  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.236988  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0254  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.97 
 
 
622 aa  345  1e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2280  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.72 
 
 
605 aa  345  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.28708e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.96 
 
 
666 aa  344  3e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0959  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.46 
 
 
635 aa  343  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0858  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.77 
 
 
655 aa  339  9e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4217  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.92 
 
 
655 aa  337  4e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4740  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.92 
 
 
655 aa  337  4e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5441  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.56 
 
 
656 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277238  normal  0.0334078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1548  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.98 
 
 
647 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545574  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2339  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.05 
 
 
639 aa  335  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.795917  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4843  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.56 
 
 
656 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0921814  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0961  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  32.18 
 
 
630 aa  335  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0230  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.6 
 
 
658 aa  335  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.6 
 
 
592 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3523  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.56 
 
 
656 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.848758  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0896  asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]  33.38 
 
 
632 aa  333  4e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2533  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.76 
 
 
625 aa  333  4e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4478  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.27 
 
 
666 aa  332  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.48246  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1938  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.18 
 
 
639 aa  332  1e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.85 
 
 
633 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641496  normal  0.029694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2884  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.1 
 
 
646 aa  332  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1119  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing  33.23 
 
 
632 aa  331  3e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0905  asparagine synthetase family protein  32.6 
 
 
637 aa  330  6e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0135  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.32 
 
 
649 aa  330  6e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.1713e-05  normal  0.012193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3988  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.71 
 
 
656 aa  330  7e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11980  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.42 
 
 
649 aa  328  2e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.658522  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1004  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.92 
 
 
656 aa  328  2e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.951042  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0358  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.28 
 
 
697 aa  328  2e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.395531 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2388  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.26 
 
 
627 aa  327  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2387  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.13 
 
 
655 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0918  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.92 
 
 
656 aa  328  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2057  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.02 
 
 
603 aa  327  3e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.825399  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0665  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.65 
 
 
623 aa  327  3e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0824019  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4334  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.72 
 
 
645 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969348  decreased coverage  0.00494377 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2247  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.92 
 
 
656 aa  328  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0082  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.76 
 
 
656 aa  327  4e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.493837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5624  putative asparagine synthetase  34.54 
 
 
656 aa  327  4e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.622425  normal  0.579265 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1535  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.76 
 
 
656 aa  327  4e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1158  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.76 
 
 
656 aa  327  4e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.433093  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1110  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.45 
 
 
637 aa  327  5e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04798  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.76 
 
 
646 aa  326  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0668  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.07 
 
 
651 aa  323  4e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.223123  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.21 
 
 
678 aa  323  5e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3175  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  31.46 
 
 
643 aa  322  1e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3049  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.01 
 
 
643 aa  321  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.524302  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5791  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.71 
 
 
627 aa  321  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2864  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.29 
 
 
678 aa  320  4e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113141  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2639  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.54 
 
 
647 aa  320  5e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.160881 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2478  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.18 
 
 
660 aa  320  5e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.669542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>