74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1448 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1448  HD-superfamily hydrolase  100 
 
 		 325 aa  673    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000046208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0730  HD-superfamily hydrolase  47.94 
 
 		 316 aa  324  1e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  45.98 
 
 		 322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0796  3'-5' exoribonuclease YhaM  46.01 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1766  HD-superfamily hydrolase  46.46 
 
 		 313 aa  298  8e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00925857  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1111  3'-5' exoribonuclease YhaM  45.51 
 
 		 314 aa  295  8e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1180  3'-5' exoribonuclease YhaM  45.51 
 
 		 314 aa  295  8e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000316143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0933  3'-5' exoribonuclease YhaM  45.51 
 
 		 314 aa  295  8e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0143521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1052  3'-5' exoribonuclease YhaM  45.51 
 
 		 314 aa  295  8e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299092  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0920  3'-5' exoribonuclease YhaM  45.51 
 
 		 314 aa  295  8e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1087  3'-5' exoribonuclease YhaM  45.51 
 
 		 314 aa  295  9e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6154099999999997e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0947  3'-5' exoribonuclease YhaM  45.51 
 
 		 314 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0716307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1012  3'-5' exoribonuclease YhaM  45.51 
 
 		 314 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4249  3'-5' exoribonuclease YhaM  45.51 
 
 		 314 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000074521 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1452  3'-5' exoribonuclease YhaM  44.87 
 
 		 376 aa  292  5e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0927  3'-5' exoribonuclease YhaM  45.19 
 
 		 314 aa  292  6e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.475944  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1773  HD domain-containing protein  44.9 
 
 		 313 aa  292  7e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0636  3'-5' exoribonuclease YhaM  44.06 
 
 		 324 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000053339  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2193  HD-superfamily hydrolase  43.61 
 
 		 314 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1895  3'-5' exoribonuclease YhaM  40.57 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.469436  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1929  3'-5' exoribonuclease YhaM  40.57 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1378  3'-5' exoribonuclease YhaM  41.12 
 
 		 313 aa  263  4e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.280441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0027  3'-5' exoribonuclease YhaM  35.46 
 
 		 323 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.838244  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0027  HD domain-containing protein  35.46 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  32.18 
 
 		 326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  30.77 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  34.06 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  32.37 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  31.04 
 
 		 388 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  30.89 
 
 		 386 aa  149  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0049  metal dependent phosphohydrolase  35.21 
 
 		 371 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2339  metal dependent phosphohydrolase  32.69 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2639  metal dependent phosphohydrolase  33.56 
 
 		 528 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130174  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4294  metal dependent phosphohydrolase  29.96 
 
 		 375 aa  143  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2543  metal dependent phosphohydrolase  33.22 
 
 		 531 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  31.49 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  33.81 
 
 		 361 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2466  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  29.23 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0701415  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  29.26 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1317  metal dependent phosphohydrolase  33 
 
 		 534 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  29.56 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 		 344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000585513  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  31.06 
 
 		 384 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  30.85 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  32.37 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000276986  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  32.45 
 
 		 534 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  30.39 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000175278  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0129  metal dependent phosphohydrolase  31.37 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3087  metal dependent phosphohydrolase  30.39 
 
 		 330 aa  132  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  28.82 
 
 		 343 aa  132  9e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1164  metal dependent phosphohydrolase  30.49 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0440  metal dependent phosphohydrolase  30.88 
 
 		 377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000386707  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  25.91 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0158  metal dependent phosphohydrolase  27.12 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5784  metal dependent phosphohydrolase  25.84 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0847  metal dependent phosphohydrolase  26.55 
 
 		 354 aa  99  9e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5827  metal dependent phosphohydrolase  26.22 
 
 		 295 aa  93.2  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163543  normal  0.236354 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0913  hypothetical protein  28.03 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1645  metal dependent phosphohydrolase  25.32 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1871  metal dependent phosphohydrolase  24.36 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0450  metal dependent phosphohydrolase  26.28 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  25.9 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1243  metal dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 		 228 aa  50.4  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0254  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 		 320 aa  49.7  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00126604  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1232  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 		 228 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1443  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 		 228 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0723  metal dependent phosphohydrolase  27.96 
 
 		 228 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0933  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0659  hypothetical protein  27.96 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.418378 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>