More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1336 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  100 
 
 
380 aa  757    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1975  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  46.27 
 
 
441 aa  354  2e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0217  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  47.38 
 
 
385 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  45.81 
 
 
386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  46.9 
 
 
354 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  44.09 
 
 
360 aa  286  5e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  43.49 
 
 
357 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  43.53 
 
 
353 aa  276  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  43.49 
 
 
357 aa  276  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5637  glycosyl transferase, group 4 family protein  43.33 
 
 
357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000033302 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  42.34 
 
 
357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  43.26 
 
 
351 aa  273  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  43.26 
 
 
351 aa  273  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5322  glycosyl transferase, group 4 family protein  43.06 
 
 
357 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  43.77 
 
 
357 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  43.77 
 
 
357 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  43.77 
 
 
357 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405483 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  43.77 
 
 
357 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  43.77 
 
 
357 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  43.75 
 
 
359 aa  261  1e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  44.37 
 
 
351 aa  257  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  41.53 
 
 
366 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  43.3 
 
 
371 aa  238  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  39.17 
 
 
353 aa  236  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2376  glycosyl transferase family 4  42.81 
 
 
312 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0310608  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  39.66 
 
 
361 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000798419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  38.85 
 
 
376 aa  226  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  40.41 
 
 
349 aa  222  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14670  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  38.54 
 
 
391 aa  206  5e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872844  decreased coverage  0.000000374023 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0525  Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  36.56 
 
 
406 aa  206  7e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000346321  unclonable  0.0000000470096 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  38.3 
 
 
495 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1971  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  38.92 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  35.33 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000955005  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  35.58 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  36.62 
 
 
326 aa  189  9e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3327  glycosyl transferase family protein  37.41 
 
 
521 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.198466 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
496 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  36.65 
 
 
762 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1677  glycosyl transferase family 4  36.67 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0281  glycosyltransferase  37.93 
 
 
357 aa  179  5.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  36.22 
 
 
542 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4628  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  36.46 
 
 
407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1886  glycosyl transferase, group 4 family protein  35.64 
 
 
319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1605  putative teichoic acid linkage unit synthesis protein  35.64 
 
 
319 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000246024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1505  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 
545 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2077  glycosyl transferase family protein  37.29 
 
 
348 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212955  hitchhiker  0.00061556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2661  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 
372 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.705684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4899  family 4 glycosyl transferase  37.33 
 
 
349 aa  168  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3472  glycosyl transferase family 4  35.33 
 
 
360 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.333059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  33.23 
 
 
355 aa  166  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1804  glycosyl transferase family 4  34.31 
 
 
367 aa  166  9e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  35.48 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0917  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  34.68 
 
 
321 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3206  family 4 glycosyl transferase  33.97 
 
 
360 aa  163  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514524  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0644  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 
369 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.666126  normal  0.192967 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3765  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 
360 aa  159  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00610476  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0327  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.88 
 
 
387 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188042 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3046  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  34.23 
 
 
600 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.014062  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4878  glycosyl transferase family protein  34.06 
 
 
369 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.777733  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0272  glycosyl transferase family 4  33.22 
 
 
330 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2593  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.34 
 
 
405 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3395  glycosyl transferase family 4  34.23 
 
 
340 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324649  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1898  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  30.21 
 
 
427 aa  151  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.18974  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0017  glycosyl transferase family protein  33.23 
 
 
333 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233702 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2580  glycosyl transferase family 4  33.56 
 
 
554 aa  150  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2161  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 
591 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4524  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183684  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2888  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 
380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000019692  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1782  glycosyl transferase family 4  33.14 
 
 
382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.219636  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1489  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  32.23 
 
 
551 aa  146  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.48779e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  34.98 
 
 
491 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1913  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  32.59 
 
 
403 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0390  glycosyl transferase family 4  28.97 
 
 
384 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0358308 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0795  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  29.48 
 
 
377 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1209  glycosyl transferase family 4  31.9 
 
 
449 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11329  undecapaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase rfe  34.38 
 
 
404 aa  142  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3884  glycosyl transferase family protein  33.95 
 
 
399 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.079088  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2395  family 4 glycosyl transferase  32.48 
 
 
372 aa  142  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.862725  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3870  glycosyl transferase family protein  33.95 
 
 
399 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0269562 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3958  glycosyl transferase family protein  33.95 
 
 
399 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2170  glycosyl transferase family 4  30.54 
 
 
375 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.228946 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13961  hypothetical protein  35.49 
 
 
352 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09950  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.1 
 
 
375 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1662  glycosyltransferase  31.87 
 
 
425 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6145  glycosyl transferase family 4  32.28 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1769  glycosyl transferase family 4  30.18 
 
 
394 aa  140  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0297431  normal  0.100208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1261  glycosyl transferase family 4  33.23 
 
 
394 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.644979  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1083  glycosyltransferase, group 4 family  30.5 
 
 
367 aa  139  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2516  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  34.25 
 
 
370 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4336  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 
405 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0580  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
375 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4145  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.16 
 
 
416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0077  glycosyl transferase family 4  35.09 
 
 
364 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0075  glycosyl transferase family 4  35.09 
 
 
364 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2116  glycosyl transferase family 4  32.28 
 
 
391 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.239722  normal  0.0546819 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1905  glycosyl transferase family 4  30.39 
 
 
399 aa  133  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2415  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 
362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1974  glycosyl transferase family 4  29.35 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3037  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  29.9 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4071  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.507876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>