More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0290 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  100 
 
 		 102 aa  206  7e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  83.33 
 
 		 102 aa  177  4.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  170  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  77.45 
 
 		 102 aa  170  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0106  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  169  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  169  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0110  30S ribosomal protein S10  76.47 
 
 		 102 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000437851  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  78.43 
 
 		 102 aa  169  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  167  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  167  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  166  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0581  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  166  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6050  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  166  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0825788  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0105  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  165  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.602740000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0103  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  165  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0103  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  165  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0121  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  165  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5859e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0130  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  165  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0140  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  165  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000306915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5196  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  165  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000324324  unclonable  1.19812e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0104  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  165  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000227261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0109  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000428723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0930  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  165  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  164  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0109  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000209715  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5123  ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.971498 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0594  SSU ribosomal protein S10P  75.49 
 
 		 102 aa  164  4e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000677882  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2647  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186933  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1908  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  163  6.9999999999999995e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000309802  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  163  8e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4322  ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  163  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  76.77 
 
 		 103 aa  163  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0057  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000459643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  76.77 
 
 		 103 aa  162  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0109  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000877818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4316  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3924  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 		 102 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1184  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 		 102 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0687  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  162  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  74.75 
 
 		 103 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2402  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 		 102 aa  161  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3906  30S ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1085  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  161  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1832  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  161  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000860395  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2319  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  161  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000523033  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2278  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  161  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000204136  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  73.74 
 
 		 103 aa  160  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10030  SSU ribosomal protein S10P  71.57 
 
 		 102 aa  159  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000017716  hitchhiker  0.00000000188362 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0961  ribosomal protein S10  71.57 
 
 		 102 aa  159  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000260411  hitchhiker  0.000000000152054 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0561  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  158  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2715  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  157  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000442606  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2400  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  157  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028025  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 103 aa  155  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2660  ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  70.59 
 
 		 107 aa  155  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0586  ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  154  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29750  SSU ribosomal protein S10P  70.59 
 
 		 102 aa  154  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20880  SSU ribosomal protein S10P  70.59 
 
 		 102 aa  154  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0626  ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  153  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3144  ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  153  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0968346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2688  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  153  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.832571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2976  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  153  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0841  ribosomal protein S10  70.59 
 
 		 102 aa  153  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17170  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0484484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  69.31 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0952  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  152  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000292109  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1706  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  152  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00186428  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23820  SSU ribosomal protein S10P  69.61 
 
 		 102 aa  152  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  69.61 
 
 		 103 aa  151  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3759  ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  150  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6615  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  150  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3436  ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  150  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5050  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  150  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.38543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1039  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  150  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1122  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  150  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03970  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  150  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.914635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1012  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  150  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1304  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  150  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155802  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1029  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  150  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.632906 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1291  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123252  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10714  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 		 101 aa  149  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.193361 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1395  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00721101  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2373  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 103 aa  148  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.837203  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4508  ribosomal protein S10  65.35 
 
 		 101 aa  148  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.815174  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1746  30S ribosomal protein S10  66 
 
 		 106 aa  148  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000231589  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 103 aa  148  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 103 aa  147  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 103 aa  147  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 103 aa  147  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2170  ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 103 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00128539  normal  0.372781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 103 aa  147  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 103 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 		 102 aa  147  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 103 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>