More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1460 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1460  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
427 aa  872    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1126  adenylosuccinate synthetase  62.91 
 
 
436 aa  561  1e-158  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00711413  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  55.74 
 
 
430 aa  511  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  55.97 
 
 
430 aa  505  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  55.97 
 
 
428 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  54.8 
 
 
428 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2536  adenylosuccinate synthetase  55.5 
 
 
427 aa  496  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  55.27 
 
 
429 aa  497  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0017  adenylosuccinate synthetase  54.33 
 
 
427 aa  490  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000177457  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0017  adenylosuccinate synthetase  54.33 
 
 
427 aa  490  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5320  adenylosuccinate synthetase  55.37 
 
 
429 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000159422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5148  adenylosuccinate synthetase  55.37 
 
 
429 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87247e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5716  adenylosuccinate synthetase  55.37 
 
 
429 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000188586  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0069  adenylosuccinate synthetase  55.14 
 
 
432 aa  482  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5577  adenylosuccinate synthetase  55.37 
 
 
429 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85689e-26 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2207  adenylosuccinate synthetase  56.07 
 
 
430 aa  478  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  52.57 
 
 
429 aa  476  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5617  adenylosuccinate synthetase  55.84 
 
 
429 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000421439  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5594  adenylosuccinate synthetase  55.61 
 
 
429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000767866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  51.42 
 
 
426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5655  adenylosuccinate synthetase  55.84 
 
 
429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000753015  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5341  adenylosuccinate synthetase  55.61 
 
 
429 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000698384  hitchhiker  0.0000000000916292 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5260  adenylosuccinate synthetase  55.61 
 
 
429 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000740199  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5164  adenylosuccinate synthetase  55.14 
 
 
429 aa  463  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000038286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  51.67 
 
 
427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  53.7 
 
 
427 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 
428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  50.12 
 
 
427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  50.48 
 
 
424 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 
430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  50.83 
 
 
427 aa  442  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 
433 aa  435  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  48.6 
 
 
431 aa  435  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  48.84 
 
 
432 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 
432 aa  438  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 
428 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 
433 aa  431  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 
427 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  47.65 
 
 
430 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 
427 aa  428  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  48.59 
 
 
430 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  50 
 
 
428 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  48.13 
 
 
433 aa  425  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  48.34 
 
 
429 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  48.35 
 
 
428 aa  426  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl074  adenylosuccinate synthetase  47.42 
 
 
429 aa  424  1e-117  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  48.36 
 
 
431 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  47.28 
 
 
427 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23100  Adenylosuccinate synthase  53.98 
 
 
428 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  46.57 
 
 
451 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  49.41 
 
 
430 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  47.78 
 
 
426 aa  419  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  49.16 
 
 
424 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0767  adenylosuccinate synthetase  46.79 
 
 
432 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1280  adenylosuccinate synthetase  48.48 
 
 
427 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  48.23 
 
 
434 aa  416  9.999999999999999e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  47.53 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  47.38 
 
 
427 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5915  adenylosuccinate synthetase  49.53 
 
 
439 aa  415  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  48.12 
 
 
427 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  47.99 
 
 
427 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  46.7 
 
 
427 aa  415  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  47.86 
 
 
427 aa  412  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0367  adenylosuccinate synthetase  49.29 
 
 
428 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  49.05 
 
 
447 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1939  adenylosuccinate synthetase  46.81 
 
 
428 aa  408  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27840  Adenylosuccinate synthetase  48.05 
 
 
438 aa  410  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  49.05 
 
 
447 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0517  adenylosuccinate synthetase  46.73 
 
 
428 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0139  adenylosuccinate synthetase  48.24 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000561019 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  46.54 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0133  adenylosuccinate synthase  47.54 
 
 
807 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279104  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  48.7 
 
 
432 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  48.33 
 
 
432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04044  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 
432 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3816  Adenylosuccinate synthase  48.82 
 
 
432 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0976  adenylosuccinate synthetase  45.54 
 
 
423 aa  402  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000393074  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 
432 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3836  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 
432 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.930032  hitchhiker  0.00000195768 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  45.95 
 
 
426 aa  404  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 
432 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  47.52 
 
 
432 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4648  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 
432 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.378806 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  47.52 
 
 
432 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  46.67 
 
 
444 aa  402  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 
432 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 
432 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 
432 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4736  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 
432 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4708  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 
432 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5693  adenylosuccinate synthetase  48.82 
 
 
432 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.580203  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  48.1 
 
 
426 aa  403  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  49.06 
 
 
432 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0492  adenylosuccinate synthetase  48.2 
 
 
428 aa  402  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  46.99 
 
 
428 aa  404  1e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04006  hypothetical protein  48.82 
 
 
432 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  47.52 
 
 
432 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3716  adenylosuccinate synthetase  47.99 
 
 
432 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  46.67 
 
 
434 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0677  adenylosuccinate synthetase  46.84 
 
 
431 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>