14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0621 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0621  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  389  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000832306  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0623  hypothetical protein  66.67 
 
 
204 aa  246  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1328  membrane protein-like protein  34.62 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.49804  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1518  hypothetical protein  33.17 
 
 
222 aa  92.4  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000363506  normal  0.716755 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1674  hypothetical protein  32.5 
 
 
250 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.347484  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0245  hypothetical protein  31.51 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0579  hypothetical protein  34.65 
 
 
248 aa  53.5  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1409  hypothetical protein  32.5 
 
 
250 aa  52.4  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.81647  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0834  hypothetical protein  30.86 
 
 
190 aa  51.6  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0082  membrane protein  33.11 
 
 
181 aa  51.6  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.224712  normal  0.42558 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1065  hypothetical protein  33.55 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0100749  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0800  membrane protein-like protein  27.91 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00107023  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08330  predicted membrane protein  29.2 
 
 
168 aa  45.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0590  hypothetical protein  31.86 
 
 
196 aa  42.4  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000937464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>