50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17100 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_00530  transposase  98.85 
 
 		 1308 bp  2474    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21460  transposase family protein  100 
 
 		 1308 bp  2593    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  unclonable  1.3054300000000002e-18  hitchhiker  0.0000742439 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17110  transposase family protein  100 
 
 		 1308 bp  2593    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20360  transposase  98.85 
 
 		 1308 bp  2474    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17100    100 
 
 		 2292 bp  4544    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0207297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02150  transposase family protein  100 
 
 		 1308 bp  2593    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02160  transposase family protein  100 
 
 		 1308 bp  2593    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24200  transposase family protein  100 
 
 		 1308 bp  2593    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25640  transposase family protein  79.52 
 
 		 1329 bp  210  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00920    81.53 
 
 		 1261 bp  200  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07920    81.53 
 
 		 1267 bp  200  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05340    81.53 
 
 		 1267 bp  200  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05280    81.25 
 
 		 1297 bp  190  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22840  transposase family protein  80.23 
 
 		 1317 bp  184  8e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15140  transposase family protein  80.23 
 
 		 1356 bp  184  8e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0303728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24210    80.23 
 
 		 2767 bp  184  8e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25960  transposase family protein  80.44 
 
 		 1311 bp  176  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25600  transposase family protein  88.36 
 
 		 1317 bp  155  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23600  transposase family protein  88.36 
 
 		 1317 bp  155  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.237959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3595  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  80 
 
 		 1137 bp  149  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104734  normal  0.17723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1262  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  80.61 
 
 		 1317 bp  147  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3311  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  80.61 
 
 		 1317 bp  147  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06980  transposase family protein  87.25 
 
 		 1317 bp  145  7e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23480  transposase family protein  87.25 
 
 		 1317 bp  145  7e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23830  transposase family protein  84.41 
 
 		 1353 bp  139  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21140  transposase family protein  84.41 
 
 		 1353 bp  139  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22680  transposase family protein  78.8 
 
 		 936 bp  135  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.971541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06410  transposase family protein  78.8 
 
 		 1308 bp  135  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04880  transposase family protein  78.8 
 
 		 1308 bp  135  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0230    85.23 
 
 		 1328 bp  121  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0928078  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09110  transposase  82.79 
 
 		 1332 bp  117  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0374233  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11890  transposase  82.79 
 
 		 1332 bp  117  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.565159  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18120  transposase family protein  82.79 
 
 		 1041 bp  117  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0064535  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22130  transposase family protein  88.68 
 
 		 1089 bp  115  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.900439  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20370  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  100 
 
 		 1515 bp  105  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02650    88.76 
 
 		 123 bp  97.6  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3284    90.28 
 
 		 249 bp  87.7  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25590    97.87 
 
 		 399 bp  85.7  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2570    85.26 
 
 		 538 bp  77.8  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.45845  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06900  transposase family protein  82.17 
 
 		 1311 bp  73.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0445695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02140  hypothetical protein  100 
 
 		 696 bp  73.8  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.558975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22440  transposase family protein  82.17 
 
 		 1311 bp  73.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0283397  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02610    82.73 
 
 		 396 bp  67.9  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4443    87.88 
 
 		 560 bp  67.9  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0149314  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17870    91.49 
 
 		 1288 bp  61.9  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.471546  normal  0.683264 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17820    91.49 
 
 		 1289 bp  61.9  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.61942  normal  0.675195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0040  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  86.36 
 
 		 1311 bp  60  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0738  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  86.36 
 
 		 1311 bp  60  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4581  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  86.36 
 
 		 1311 bp  60  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1436    82.35 
 
 		 1318 bp  50.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.295411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>