42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0230 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_25640  transposase family protein  83.06 
 
 		 1329 bp  646    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0230    100 
 
 		 1328 bp  2633    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0928078  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3595  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  99.12 
 
 		 1137 bp  2173    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104734  normal  0.17723 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05280    82.88 
 
 		 1297 bp  624  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00920    82.78 
 
 		 1261 bp  617  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07920    82.78 
 
 		 1267 bp  617  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05340    82.78 
 
 		 1267 bp  617  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09110  transposase  79.96 
 
 		 1332 bp  420  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0374233  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11890  transposase  79.96 
 
 		 1332 bp  420  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.565159  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18120  transposase family protein  80.22 
 
 		 1041 bp  400  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0064535  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22840  transposase family protein  79.03 
 
 		 1317 bp  232  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24210    78.51 
 
 		 2767 bp  228  3e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15140  transposase family protein  78.51 
 
 		 1356 bp  228  3e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0303728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3311  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  89.33 
 
 		 1317 bp  202  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1262  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  89.33 
 
 		 1317 bp  202  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23600  transposase family protein  81.09 
 
 		 1317 bp  182  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.237959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25600  transposase family protein  81.09 
 
 		 1317 bp  182  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21140  transposase family protein  87.01 
 
 		 1353 bp  168  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23830  transposase family protein  87.01 
 
 		 1353 bp  168  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22130  transposase family protein  82.61 
 
 		 1089 bp  167  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.900439  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06410  transposase family protein  78.04 
 
 		 1308 bp  157  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04880  transposase family protein  78.04 
 
 		 1308 bp  157  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06980  transposase family protein  81.58 
 
 		 1317 bp  139  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22680  transposase family protein  78.36 
 
 		 936 bp  137  9e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.971541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23480  transposase family protein  78.93 
 
 		 1317 bp  135  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20360  transposase  85.91 
 
 		 1308 bp  129  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00530  transposase  85.91 
 
 		 1308 bp  129  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25960  transposase family protein  86.01 
 
 		 1311 bp  125  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21460  transposase family protein  85.23 
 
 		 1308 bp  121  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  unclonable  1.3054300000000002e-18  hitchhiker  0.0000742439 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24200  transposase family protein  85.23 
 
 		 1308 bp  121  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17110  transposase family protein  85.23 
 
 		 1308 bp  121  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17100    85.23 
 
 		 2292 bp  121  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0207297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02160  transposase family protein  85.23 
 
 		 1308 bp  121  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02150  transposase family protein  85.23 
 
 		 1308 bp  121  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06900  transposase family protein  82.81 
 
 		 1311 bp  103  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0445695  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22440  transposase family protein  82.81 
 
 		 1311 bp  103  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0283397  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2570    85.34 
 
 		 538 bp  95.6  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.45845  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02650    86.32 
 
 		 123 bp  85.7  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1436    88.46 
 
 		 1318 bp  56  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.295411 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0990  transposase  85.94 
 
 		 534 bp  56  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 600 bp  52  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12460  hypothetical protein  100 
 
 		 636 bp  52  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>