24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3284 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3284    100 
 
 
249 bp  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3311  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  100 
 
 
1317 bp  236  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1262  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  100 
 
 
1317 bp  236  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22840  transposase family protein  90.74 
 
 
1317 bp  135  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15140  transposase family protein  89.81 
 
 
1356 bp  127  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0303728  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24210    93.98 
 
 
2767 bp  125  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343525  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02150  transposase family protein  90.28 
 
 
1308 bp  87.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02160  transposase family protein  90.28 
 
 
1308 bp  87.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290407  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17100    90.28 
 
 
2292 bp  87.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0207297  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17110  transposase family protein  90.28 
 
 
1308 bp  87.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21460  transposase family protein  90.28 
 
 
1308 bp  87.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  unclonable  1.3054300000000002e-18  hitchhiker  0.0000742439 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24200  transposase family protein  90.28 
 
 
1308 bp  87.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20360  transposase  88.89 
 
 
1308 bp  79.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00530  transposase  88.89 
 
 
1308 bp  79.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23830  transposase family protein  90.74 
 
 
1353 bp  67.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21140  transposase family protein  90.74 
 
 
1353 bp  67.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23600  transposase family protein  93.33 
 
 
1317 bp  65.9  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.237959  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25590    93.33 
 
 
399 bp  65.9  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25600  transposase family protein  93.33 
 
 
1317 bp  65.9  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02610    82.57 
 
 
396 bp  65.9  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2570    86.44 
 
 
538 bp  54  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.45845  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23480  transposase family protein  82.35 
 
 
1317 bp  50.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06980  transposase family protein  82.35 
 
 
1317 bp  50.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1217  transposase IS3/IS911 family protein  88.64 
 
 
327 bp  48.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>