25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02610 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_02610    100 
 
 
396 bp  785    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23600  transposase family protein  83.5 
 
 
1317 bp  204  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.237959  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25600  transposase family protein  83.5 
 
 
1317 bp  204  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06980  transposase family protein  83.69 
 
 
1317 bp  194  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23480  transposase family protein  83.69 
 
 
1317 bp  194  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25590    85.9 
 
 
399 bp  135  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00530  transposase  83.64 
 
 
1308 bp  75.8  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20360  transposase  83.64 
 
 
1308 bp  75.8  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24200  transposase family protein  82.73 
 
 
1308 bp  67.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21460  transposase family protein  82.73 
 
 
1308 bp  67.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  unclonable  1.3054300000000002e-18  hitchhiker  0.0000742439 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17110  transposase family protein  82.73 
 
 
1308 bp  67.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17100    82.73 
 
 
2292 bp  67.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0207297  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02160  transposase family protein  82.73 
 
 
1308 bp  67.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290407  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02150  transposase family protein  82.73 
 
 
1308 bp  67.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1262  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  82.57 
 
 
1317 bp  65.9  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3284    82.57 
 
 
249 bp  65.9  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3311  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  82.57 
 
 
1317 bp  65.9  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23830  transposase family protein  90.2 
 
 
1353 bp  61.9  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21140  transposase family protein  90.2 
 
 
1353 bp  61.9  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22840  transposase family protein  85.29 
 
 
1317 bp  56  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2085    100 
 
 
213 bp  56  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.453938  normal  0.264532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25960  transposase family protein  84.85 
 
 
1311 bp  52  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24210    83.82 
 
 
2767 bp  48.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343525  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2570    79.84 
 
 
538 bp  48.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.45845  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15140  transposase family protein  83.82 
 
 
1356 bp  48.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0303728  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>