More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0883 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0883  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 140 aa  275  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.061821  hitchhiker  0.00451054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  45.99 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0473  Fur family ferric uptake regulator  41.54 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6836  ferric uptake regulator, Fur family  44.12 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  45.11 
 
 		 174 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  44.36 
 
 		 143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0061  FUR family nickel uptake regulator  42.31 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5708  ferric uptake regulator, Fur family  42.22 
 
 		 143 aa  98.6  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  38.46 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8242  ferric uptake regulator, Fur family  44.44 
 
 		 144 aa  93.6  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4626  ferric uptake regulator, Fur family  44.76 
 
 		 159 aa  92  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795409  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  34.85 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6149  ferric uptake regulator family protein  42.54 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  34.85 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  31.54 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0654  ferric uptake regulator, Fur family  38.41 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  30 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  30.16 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  38.06 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  34.51 
 
 		 186 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  31.69 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  34.48 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1147  FUR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  33.79 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  34.48 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  32.31 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0199  ferric uptake regulator, Fur family  32.52 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  26.15 
 
 		 143 aa  66.6  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  35.38 
 
 		 147 aa  66.6  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  32.61 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0980  ferric uptake regulator family protein  29.55 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.875301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  31.25 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  40.91 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  29.55 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  30.6 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  30.65 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  33.81 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2661  ferric uptake regulator family protein  37.04 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.946961  normal  0.0414019 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  31.21 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  33.33 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  28.79 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  27.97 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  30.65 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  29.1 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  32.33 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  28.79 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  33.81 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  28.79 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  28.79 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  28.79 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  28.79 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  33.81 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  28.79 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  28.46 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  34.35 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  29.58 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1775  ferric uptake regulator family protein  33.81 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.103697  normal  0.0302993 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  32.82 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1216  ferric uptake regulator, Fur family  36.76 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  23.85 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  28.36 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  33.59 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0768  iron ABC transporter  28.47 
 
 		 145 aa  62  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  34.31 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  31.78 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  34.81 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  35.43 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  30.15 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  30.28 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  33.8 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2170  ferric uptake regulator family protein  29.93 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.414225 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  28.03 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  30.5 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  23.94 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  28.15 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  31.01 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  27.34 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1224  ferric uptake regulator family protein  30.88 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293203  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  24.48 
 
 		 152 aa  60.1  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  25 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  30.28 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  29.01 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  30.28 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  30.28 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  25 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1505  FUR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000456774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21260  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  35.07 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570442  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5530  ferric uptake regulator family protein  32.81 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  30.28 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0058  ferric uptake regulator family protein  26.28 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0235193  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>